RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 HYPKQ9NX55 129 aa26.97■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 BEND3Q5T5X7 828 aa26.96■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.95■■□□□ 1.9
SH3BP5-204ENST00000412806 SEC24BO95487 1268 aa26.95■■□□□ 1.9
SH3BP5-204ENST00000412806 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.95■■□□□ 1.9
SH3BP5-204ENST00000412806 HMMRO75330 724 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP5-204ENST00000412806 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
SH3BP5-204ENST00000412806 NRAPQ86VF7 1730 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP5-204ENST00000412806 DISP2A7MBM2 1401 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP5-204ENST00000412806 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP5-204ENST00000412806 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
SH3BP5-204ENST00000412806 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
SH3BP5-204ENST00000412806 PIP4K2BP78356 416 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP5-204ENST00000412806 KSR2Q6VAB6 950 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP5-204ENST00000412806 USP16Q9Y5T5 823 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP5-204ENST00000412806 ITGB4P16144 1822 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP5-204ENST00000412806 TOM1O60784 492 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP5-204ENST00000412806 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP5-204ENST00000412806 ATP8B2P98198 1209 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP5-204ENST00000412806 MYL6BP14649 208 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP5-204ENST00000412806 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
SH3BP5-204ENST00000412806 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP5-204ENST00000412806 ADAMTS2O95450 1211 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP5-204ENST00000412806 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
SH3BP5-204ENST00000412806 APBB1O00213 710 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP5-204ENST00000412806 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
SH3BP5-204ENST00000412806 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
SH3BP5-204ENST00000412806 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP5-204ENST00000412806 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
SH3BP5-204ENST00000412806 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP5-204ENST00000412806 BMP2KLQ5H9B9 411 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP5-204ENST00000412806 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
SH3BP5-204ENST00000412806 TNS2Q63HR2 1409 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP5-204ENST00000412806 ALDH1L1O75891 902 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BP5-204ENST00000412806 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SH3BP5-204ENST00000412806 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BP5-204ENST00000412806 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BP5-204ENST00000412806 COPS6Q7L5N1 327 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP5-204ENST00000412806 BCL11AQ9H165 835 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP5-204ENST00000412806 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP5-204ENST00000412806 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
SH3BP5-204ENST00000412806 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.82■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.81■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 LINS1Q8NG48 757 aa26.81■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.8■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 LRP6O75581 1613 aa26.8■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.8■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 SSH3Q8TE77 659 aa26.8■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.79■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.79■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.79■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 POLA2Q14181 598 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 IGKV5-2P06315 115 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 EXOC5O00471 708 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.76■■□□□ 1.88
SH3BP5-204ENST00000412806 ERBB4Q15303 1308 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 NBPF26B4DH59 902 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 NBPF14Q5TI25 921 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 NBPF15Q8N660 670 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 PIGBQ92521 554 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 TTC22Q5TAA0 569 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 LRRCC1Q9C099 1032 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 SLIT2O94813 1529 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 MYD88Q99836 296 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 UTYO14607 1347 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 GRM8O00222 908 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 SRGAP3O43295 1099 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 A1BGP04217 495 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 MTX1Q13505 466 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 ATG3Q9NT62 314 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 SUCLG2Q96I99 432 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 BCL9O00512 1426 aa26.7■■□□□ 1.87
SH3BP5-204ENST00000412806 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP5-204ENST00000412806 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms