RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 SLAIN2Q9P270 581 aa24.93■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 AOX1Q06278 1338 aa24.93■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.92■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 PDE1AP54750 535 aa24.92■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 KSR2Q6VAB6 950 aa24.92■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 ABCA3Q99758 1704 aa24.91■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.91■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 MTX1Q13505 466 aa24.9■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 HSCBQ8IWL3 235 aa24.9■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.9■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.9■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 SDSP20132 328 aa24.9■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 STAP2Q9UGK3 403 aa24.9■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.89■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 CHRNA2Q15822 529 aa24.88■■□□□ 1.57
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SUMO3-204ENST00000411651 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.87■■□□□ 1.57
SUMO3-204ENST00000411651 KIF2CQ99661 725 aa24.87■■□□□ 1.57
SUMO3-204ENST00000411651 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SUMO3-204ENST00000411651 C5P01031 1676 aa24.87■■□□□ 1.57
SUMO3-204ENST00000411651 CYP27B1O15528 508 aa24.86■■□□□ 1.57
SUMO3-204ENST00000411651 UTYO14607 1347 aa24.86■■□□□ 1.57
SUMO3-204ENST00000411651 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.86■■□□□ 1.57
SUMO3-204ENST00000411651 MX1P20591 662 aa24.85■■□□□ 1.57
SUMO3-204ENST00000411651 PDIA6Q15084 440 aa24.85■■□□□ 1.57
SUMO3-204ENST00000411651 LINS1Q8NG48 757 aa24.85■■□□□ 1.57
SUMO3-204ENST00000411651 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.85■■□□□ 1.57
SUMO3-204ENST00000411651 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.85■■□□□ 1.57
SUMO3-204ENST00000411651 APBB1O00213 710 aa24.84■■□□□ 1.57
SUMO3-204ENST00000411651 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SUMO3-204ENST00000411651 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.84■■□□□ 1.57
SUMO3-204ENST00000411651 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.84■■□□□ 1.57
SUMO3-204ENST00000411651 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.84■■□□□ 1.57
SUMO3-204ENST00000411651 REC8O95072 547 aa24.83■■□□□ 1.57
SUMO3-204ENST00000411651 PROSER3Q2NL68 480 aa24.83■■□□□ 1.57
SUMO3-204ENST00000411651 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.83■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 ANXA1P04083 346 aa24.82■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.82■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 USP26Q9BXU7 913 aa24.82■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 SRGAP3O43295 1099 aa24.81■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.81■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.81■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 ERBB4Q15303 1308 aa24.81■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.8■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 GLI3P10071 1580 aa24.8■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.8■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 RABEP1Q15276 862 aa24.8■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 ERC2O15083 957 aa24.79■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.79■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 SLC39A6Q13433 755 aa24.78■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.78■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.78■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 CABP4P57796 275 aa24.77■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SUMO3-204ENST00000411651 GRM8O00222 908 aa24.76■■□□□ 1.55
SUMO3-204ENST00000411651 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.76■■□□□ 1.55
SUMO3-204ENST00000411651 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.76■■□□□ 1.55
SUMO3-204ENST00000411651 PAPPAQ13219 1627 aa24.76■■□□□ 1.55
SUMO3-204ENST00000411651 DDIT3P35638 169 aa24.76■■□□□ 1.55
SUMO3-204ENST00000411651 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.76■■□□□ 1.55
SUMO3-204ENST00000411651 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.76■■□□□ 1.55
SUMO3-204ENST00000411651 COL15A1P39059 1388 aa24.76■■□□□ 1.55
SUMO3-204ENST00000411651 IL27Q8NEV9 243 aa24.75■■□□□ 1.55
SUMO3-204ENST00000411651 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-204ENST00000411651 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-204ENST00000411651 IL2RBP14784 551 aa24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-204ENST00000411651 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SUMO3-204ENST00000411651 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SUMO3-204ENST00000411651 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.73■■□□□ 1.55
SUMO3-204ENST00000411651 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.73■■□□□ 1.55
SUMO3-204ENST00000411651 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24.72■■□□□ 1.55
SUMO3-204ENST00000411651 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-204ENST00000411651 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-204ENST00000411651 IL17RAQ96F46 866 aa24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-204ENST00000411651 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-204ENST00000411651 IGKV5-2P06315 115 aa24.7■■□□□ 1.54
SUMO3-204ENST00000411651 TNS2Q63HR2 1409 aa24.69■■□□□ 1.54
SUMO3-204ENST00000411651 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.69■■□□□ 1.54
SUMO3-204ENST00000411651 CHMLP26374 656 aa24.69■■□□□ 1.54
SUMO3-204ENST00000411651 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.69■■□□□ 1.54
SUMO3-204ENST00000411651 COPS6Q7L5N1 327 aa24.69■■□□□ 1.54
SUMO3-204ENST00000411651 PI4K2BQ8TCG2 481 aa24.69■■□□□ 1.54
SUMO3-204ENST00000411651 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.69■■□□□ 1.54
SUMO3-204ENST00000411651 USP16Q9Y5T5 823 aa24.69■■□□□ 1.54
SUMO3-204ENST00000411651 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.68■■□□□ 1.54
SUMO3-204ENST00000411651 GCKRQ14397 625 aa24.68■■□□□ 1.54
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