RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401533.6

GAREM2-201, Transcript of GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GAREM2, Length 4,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAREM2-201ENST00000401533 PSMA5P28066 241 aa22.21■■□□□ 1.15
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GAREM2-201ENST00000401533 TMX3Q96JJ7 454 aa22.2■■□□□ 1.15
GAREM2-201ENST00000401533 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
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GAREM2-201ENST00000401533 FLT4P35916 1363 aa22.2■■□□□ 1.14
GAREM2-201ENST00000401533 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.2■■□□□ 1.14
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GAREM2-201ENST00000401533 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.19■■□□□ 1.14
GAREM2-201ENST00000401533 TSPY26PQ9H489 355 aa22.19■■□□□ 1.14
GAREM2-201ENST00000401533 ATP8B2P98198 1209 aa22.18■■□□□ 1.14
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GAREM2-201ENST00000401533 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.18■■□□□ 1.14
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GAREM2-201ENST00000401533 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.17■■□□□ 1.14
GAREM2-201ENST00000401533 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.17■■□□□ 1.14
GAREM2-201ENST00000401533 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.17■■□□□ 1.14
GAREM2-201ENST00000401533 RAB11FIP3O75154 756 aa22.17■■□□□ 1.14
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GAREM2-201ENST00000401533 A0A087WZG4 1122 aa22.16■■□□□ 1.14
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GAREM2-201ENST00000401533 USP26Q9BXU7 913 aa22.16■■□□□ 1.14
GAREM2-201ENST00000401533 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.15■■□□□ 1.14
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GAREM2-201ENST00000401533 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.15■■□□□ 1.14
GAREM2-201ENST00000401533 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.15■■□□□ 1.14
GAREM2-201ENST00000401533 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.14■■□□□ 1.14
GAREM2-201ENST00000401533 SNX21Q969T3 373 aa22.14■■□□□ 1.14
GAREM2-201ENST00000401533 ALKQ9UM73 1620 aa22.14■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 ATP2B1P20020 1258 aa22.14■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.13■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 GCP02774 474 aa22.13■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.13■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 COPS6Q7L5N1 327 aa22.13■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 NECAB1Q8N987 351 aa22.13■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.13■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 KCNQ3O43525 872 aa22.13■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 CAMK4Q16566 473 aa22.13■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.13■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.13■■□□□ 1.13
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GAREM2-201ENST00000401533 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
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GAREM2-201ENST00000401533 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.12■■□□□ 1.13
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GAREM2-201ENST00000401533 TBX22Q9Y458 520 aa22.12■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 USP19O94966 1318 aa22.11■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 HIP1O00291 1037 aa22.11■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
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GAREM2-201ENST00000401533 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.11■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.11■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.1■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 IL17REQ8NFR9 667 aa22.1■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.1■■□□□ 1.13
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GAREM2-201ENST00000401533 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.09■■□□□ 1.13
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GAREM2-201ENST00000401533 GUCY1B3Q02153 619 aa22.09■■□□□ 1.13
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GAREM2-201ENST00000401533 ABCC4O15439 1325 aa22.08■■□□□ 1.13
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GAREM2-201ENST00000401533 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.08■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.08■■□□□ 1.13
GAREM2-201ENST00000401533 CHMLP26374 656 aa22.08■■□□□ 1.12
GAREM2-201ENST00000401533 TRIM5Q9C035 493 aa22.08■■□□□ 1.12
GAREM2-201ENST00000401533 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.07■■□□□ 1.12
GAREM2-201ENST00000401533 KRT85P78386 507 aa22.07■■□□□ 1.12
GAREM2-201ENST00000401533 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
GAREM2-201ENST00000401533 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.07■■□□□ 1.12
GAREM2-201ENST00000401533 VPS37DQ86XT2 251 aa22.07■■□□□ 1.12
GAREM2-201ENST00000401533 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.07■■□□□ 1.12
GAREM2-201ENST00000401533 GPTP24298 496 aa22.06■■□□□ 1.12
GAREM2-201ENST00000401533 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.06■■□□□ 1.12
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