RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 YY1P25490 414 aa26.8■■□□□ 1.88
ANKRD39-201ENST00000393537 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
ANKRD39-201ENST00000393537 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
ANKRD39-201ENST00000393537 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
ANKRD39-201ENST00000393537 COL15A1P39059 1388 aa26.79■■□□□ 1.88
ANKRD39-201ENST00000393537 FKBP8Q14318 412 aa26.77■■□□□ 1.88
ANKRD39-201ENST00000393537 CHD4Q14839 1912 aa26.77■■□□□ 1.88
ANKRD39-201ENST00000393537 ZPR1O75312 459 aa26.76■■□□□ 1.87
ANKRD39-201ENST00000393537 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
ANKRD39-201ENST00000393537 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.75■■□□□ 1.87
ANKRD39-201ENST00000393537 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.75■■□□□ 1.87
ANKRD39-201ENST00000393537 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.74■■□□□ 1.87
ANKRD39-201ENST00000393537 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
ANKRD39-201ENST00000393537 NARFQ9UHQ1 456 aa26.74■■□□□ 1.87
ANKRD39-201ENST00000393537 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.873e-7■■□□□ 13.4
ANKRD39-201ENST00000393537 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.73■■□□□ 1.87
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
ANKRD39-201ENST00000393537 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.72■■□□□ 1.87
ANKRD39-201ENST00000393537 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.71■■□□□ 1.87
ANKRD39-201ENST00000393537 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.71■■□□□ 1.87
ANKRD39-201ENST00000393537 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 A1BGP04217 495 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 DDR1Q08345 913 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 USP16Q9Y5T5 823 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A087WZG4 1122 aa26.69■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 RIPK4P57078 832 aa26.69■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.69■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.68■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 TM4SF1P30408 202 aa26.67■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.67■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.67■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 GRIN3BO60391 1043 aa26.66■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.66■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 TGFB2P61812 414 aa26.65■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 NFIXQ14938 502 aa26.65■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 RUNDC1Q96C34 613 aa26.65■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.65■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 SCN7AQ01118 1682 aa26.65■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.64■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
ANKRD39-201ENST00000393537 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
ANKRD39-201ENST00000393537 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.63■■□□□ 1.85
ANKRD39-201ENST00000393537 NEUROD2Q15784 382 aa26.63■■□□□ 1.85
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A0G2JLW4 131 aa26.62■■□□□ 1.85
ANKRD39-201ENST00000393537 DPEP1P16444 411 aa26.61■■□□□ 1.85
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
ANKRD39-201ENST00000393537 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.59■■□□□ 1.85
ANKRD39-201ENST00000393537 BCORQ6W2J9 1755 aa26.59■■□□□ 1.85
ANKRD39-201ENST00000393537 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.59■■□□□ 1.85
ANKRD39-201ENST00000393537 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.59■■□□□ 1.85
ANKRD39-201ENST00000393537 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
ANKRD39-201ENST00000393537 NBPF26B4DH59 902 aa26.58■■□□□ 1.85
ANKRD39-201ENST00000393537 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
ANKRD39-201ENST00000393537 SERPINB2P05120 415 aa26.58■■□□□ 1.85
ANKRD39-201ENST00000393537 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
ANKRD39-201ENST00000393537 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
ANKRD39-201ENST00000393537 NBPF15Q8N660 670 aa26.58■■□□□ 1.85
ANKRD39-201ENST00000393537 CAMTA2O94983 1202 aa26.57■■□□□ 1.84
ANKRD39-201ENST00000393537 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.57■■□□□ 1.84
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.55■■□□□ 1.84
ANKRD39-201ENST00000393537 BCS1LQ9Y276 419 aa26.55■■□□□ 1.84
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNA3P22001 575 aa26.53■■□□□ 1.84
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC184Q52MB2 194 aa26.53■■□□□ 1.84
ANKRD39-201ENST00000393537 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.53■■□□□ 1.84
ANKRD39-201ENST00000393537 CHRNA5P30532 468 aa26.52■■□□□ 1.84
ANKRD39-201ENST00000393537 UTRNP46939 3433 aa26.51■■□□□ 1.83
ANKRD39-201ENST00000393537 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.51■■□□□ 1.83
ANKRD39-201ENST00000393537 PIM2Q9P1W9 311 aa26.51■■□□□ 1.83
ANKRD39-201ENST00000393537 ANP32CO43423 234 aa26.5■■□□□ 1.83
ANKRD39-201ENST00000393537 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.49■■□□□ 1.83
ANKRD39-201ENST00000393537 SETDB2Q96T68 719 aa26.49■■□□□ 1.83
ANKRD39-201ENST00000393537 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
ANKRD39-201ENST00000393537 APAF1O14727 1248 aa26.48■■□□□ 1.83
ANKRD39-201ENST00000393537 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.48■■□□□ 1.83
ANKRD39-201ENST00000393537 NGEFQ8N5V2 710 aa26.48■■□□□ 1.83
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.48■■□□□ 1.83
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD39-201ENST00000393537 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.46■■□□□ 1.83
ANKRD39-201ENST00000393537 CHL1O00533 1208 aa26.46■■□□□ 1.83
ANKRD39-201ENST00000393537 MYL6BP14649 208 aa26.46■■□□□ 1.83
ANKRD39-201ENST00000393537 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
ANKRD39-201ENST00000393537 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.46■■□□□ 1.83
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.45■■□□□ 1.82
ANKRD39-201ENST00000393537 ERBB4Q15303 1308 aa26.44■■□□□ 1.82
ANKRD39-201ENST00000393537 NPHP1O15259 732 aa26.44■■□□□ 1.82
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
ANKRD39-201ENST00000393537 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms