RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 SAMD9Q5K651 1589 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 CABLES1Q8TDN4 633 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 TCHPQ9BT92 498 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 RMI1Q9H9A7 625 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 BCAR3O75815 825 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 INCENPQ9NQS7 918 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 VEZTQ9HBM0 779 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 SKAP1Q86WV1 359 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 SLC20A2Q08357 652 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 USHBP1Q8N6Y0 703 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 ACEP12821 1306 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 DISP3Q9P2K9 1392 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 CABP4P57796 275 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 TSPY26PQ9H489 355 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 GAS2L2Q8NHY3 880 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 UBXN4Q92575 508 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 PRR29P0C7W0 189 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 GUCY2CP25092 1073 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 NPHP3Q7Z494 1330 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 RLBP1P12271 317 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 ZSCAN26Q16670 478 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 ARMC9Q7Z3E5 817 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 KIF18AQ8NI77 898 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 SPG7Q9UQ90 795 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 CA8P35219 290 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 FAM210AQ96ND0 272 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 BCL2L12Q9HB09 334 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 TBX22Q9Y458 520 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 PZPP20742 1482 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 MMP14P50281 582 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 MCTP2Q6DN12 878 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 RINLQ6ZS11 566 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CTIF-202ENST00000382998 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 CRACR2AQ9BSW2 395 aa16.02■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 CAND2O75155 1236 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 C20orf194Q5TEA3 1177 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 CAPN2P17655 700 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 WDR66Q8TBY9 1149 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 ZNF428Q96B54 188 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 KIF2CQ99661 725 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 25.6
CTIF-202ENST00000382998 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 TRDNQ13061 729 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 KIF4AO95239 1232 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 MICALCLQ6ZW33 695 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 ATP7AQ04656 1500 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 SHTN1A0MZ66 631 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 CTAGE5O15320 804 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 FBLN1P23142 703 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 CCDC102AQ96A19 550 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 KAT6BQ8WYB5 2073 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 LTKP29376 864 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 SH3GL3Q99963 347 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 NSD3Q9BZ95 1437 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 DDX58O95786 925 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 WHAMMQ8TF30 809 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 GNAI1P63096 354 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 GTF3C6Q969F1 213 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 MYO1CO00159 1063 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 DCTN1Q14203 1278 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 NFXL1Q6ZNB6 911 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 28.6
CTIF-202ENST00000382998 MAFGO15525 162 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 ERCC3P19447 782 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 RALGAPBQ86X10 1494 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 ATP2B3Q16720 1220 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 ORAI2Q96SN7 254 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-202ENST00000382998 EXOC5O00471 708 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101 ms