RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380750.7

SERF1B-201, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1B, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-201ENST00000380750 PLCH1Q4KWH8 1693 aa30.38■■■□□ 2.45
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SERF1B-201ENST00000380750 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.36■■■□□ 2.45
SERF1B-201ENST00000380750 GLI3P10071 1580 aa30.36■■■□□ 2.45
SERF1B-201ENST00000380750 USP16Q9Y5T5 823 aa30.35■■■□□ 2.45
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SERF1B-201ENST00000380750 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
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SERF1B-201ENST00000380750 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
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SERF1B-201ENST00000380750 XAGE3Q8WTP9 111 aa30.27■■■□□ 2.44
SERF1B-201ENST00000380750 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
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SERF1B-201ENST00000380750 COPS6Q7L5N1 327 aa30.26■■■□□ 2.43
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SERF1B-201ENST00000380750 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa30.25■■■□□ 2.43
SERF1B-201ENST00000380750 SLIT2O94813 1529 aa30.25■■■□□ 2.43
SERF1B-201ENST00000380750 RIC3Q7Z5B4 369 aa30.24■■■□□ 2.43
SERF1B-201ENST00000380750 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
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SERF1B-201ENST00000380750 LRP6O75581 1613 aa30.23■■■□□ 2.43
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SERF1B-201ENST00000380750 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
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SERF1B-201ENST00000380750 TTC22Q5TAA0 569 aa30.09■■■□□ 2.41
SERF1B-201ENST00000380750 BCL11AQ9H165 835 aa30.09■■■□□ 2.41
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