RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380283.4

PXDC1-202, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PXDC1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-202ENST00000380283 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa32.26■■■□□ 2.76
PXDC1-202ENST00000380283 RBSNQ9H1K0 784 aa32.26■■■□□ 2.76
PXDC1-202ENST00000380283 NLRP2Q9NX02 1062 aa32.26■■■□□ 2.76
PXDC1-202ENST00000380283 ZDHHC9Q9Y397 364 aa32.26■■■□□ 2.76
PXDC1-202ENST00000380283 MCM10Q7L590 875 aa32.25■■■□□ 2.75
PXDC1-202ENST00000380283 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
PXDC1-202ENST00000380283 PTPRCP08575 1304 aa32.25■■■□□ 2.75
PXDC1-202ENST00000380283 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
PXDC1-202ENST00000380283 GPT2Q8TD30 523 aa32.24■■■□□ 2.75
PXDC1-202ENST00000380283 NCLP19338 710 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
PXDC1-202ENST00000380283 PHLPP1O60346 1717 aa32.23■■■□□ 2.75
PXDC1-202ENST00000380283 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa32.23■■■□□ 2.75
PXDC1-202ENST00000380283 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
PXDC1-202ENST00000380283 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
PXDC1-202ENST00000380283 OSBPL3Q9H4L5 887 aa32.22■■■□□ 2.75
PXDC1-202ENST00000380283 CHL1O00533 1208 aa32.22■■■□□ 2.75
PXDC1-202ENST00000380283 ERC2O15083 957 aa32.22■■■□□ 2.75
PXDC1-202ENST00000380283 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
PXDC1-202ENST00000380283 CERKQ8TCT0 537 aa32.22■■■□□ 2.75
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PXDC1-202ENST00000380283 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa32.21■■■□□ 2.75
PXDC1-202ENST00000380283 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
PXDC1-202ENST00000380283 LMO7Q8WWI1 1683 aa32.2■■■□□ 2.75
PXDC1-202ENST00000380283 GNAT3A8MTJ3 354 aa32.2■■■□□ 2.75
PXDC1-202ENST00000380283 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
PXDC1-202ENST00000380283 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
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PXDC1-202ENST00000380283 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
PXDC1-202ENST00000380283 LRSAM1Q6UWE0 723 aa32.18■■■□□ 2.74
PXDC1-202ENST00000380283 AMOTQ4VCS5 1084 aa32.17■■■□□ 2.74
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PXDC1-202ENST00000380283 WDR17Q8IZU2 1322 aa32.16■■■□□ 2.74
PXDC1-202ENST00000380283 VSIG10Q8N0Z9 540 aa32.15■■■□□ 2.74
PXDC1-202ENST00000380283 MAP3K5Q99683 1374 aa32.15■■■□□ 2.74
PXDC1-202ENST00000380283 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa32.15■■■□□ 2.74
PXDC1-202ENST00000380283 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
PXDC1-202ENST00000380283 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
PXDC1-202ENST00000380283 HMMRO75330 724 aa32.14■■■□□ 2.74
PXDC1-202ENST00000380283 MCM5P33992 734 aa32.14■■■□□ 2.74
PXDC1-202ENST00000380283 TMEM63CQ9P1W3 806 aa32.14■■■□□ 2.74
PXDC1-202ENST00000380283 MCM2P49736 904 aa32.14■■■□□ 2.73
PXDC1-202ENST00000380283 KRT24Q2M2I5 525 aa32.14■■■□□ 2.73
PXDC1-202ENST00000380283 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.73
PXDC1-202ENST00000380283 CRB1P82279 1406 aa32.13■■■□□ 2.73
PXDC1-202ENST00000380283 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa32.12■■■□□ 2.73
PXDC1-202ENST00000380283 MBD3O95983 291 aa32.12■■■□□ 2.73
PXDC1-202ENST00000380283 PDE1AP54750 535 aa32.12■■■□□ 2.73
PXDC1-202ENST00000380283 IL17REQ8NFR9 667 aa32.12■■■□□ 2.73
PXDC1-202ENST00000380283 EVA1CP58658 441 aa32.11■■■□□ 2.73
PXDC1-202ENST00000380283 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
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PXDC1-202ENST00000380283 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa32.11■■■□□ 2.73
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PXDC1-202ENST00000380283 TMX3Q96JJ7 454 aa32.09■■■□□ 2.73
PXDC1-202ENST00000380283 AKAP4Q5JQC9 854 aa32.09■■■□□ 2.73
PXDC1-202ENST00000380283 BTG4Q9NY30 223 aa32.09■■■□□ 2.73
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PXDC1-202ENST00000380283 ZMYND15Q9H091 742 aa32.08■■■□□ 2.73
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PXDC1-202ENST00000380283 NEK4P51957 841 aa32.06■■■□□ 2.72
PXDC1-202ENST00000380283 C1orf141Q5JVX7 400 aa32.06■■■□□ 2.72
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PXDC1-202ENST00000380283 SYCE3A1L190 88 aa32.05■■■□□ 2.72
PXDC1-202ENST00000380283 IL17RAQ96F46 866 aa32.05■■■□□ 2.72
PXDC1-202ENST00000380283 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
PXDC1-202ENST00000380283 CARD10Q9BWT7 1032 aa32.05■■■□□ 2.72
PXDC1-202ENST00000380283 MIS18AQ9NYP9 233 aa32.05■■■□□ 2.72
PXDC1-202ENST00000380283 ANAPC15P60006 121 aa32.04■■■□□ 2.72
PXDC1-202ENST00000380283 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa32.04■■■□□ 2.72
PXDC1-202ENST00000380283 CCDC39Q9UFE4 941 aa32.04■■■□□ 2.72
PXDC1-202ENST00000380283 ADAMTS2O95450 1211 aa32.04■■■□□ 2.72
PXDC1-202ENST00000380283 LGR6Q9HBX8 967 aa32.04■■■□□ 2.72
PXDC1-202ENST00000380283 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP32.04■■■□□ 2.72
PXDC1-202ENST00000380283 SLC4A2P04920 1241 aa32.03■■■□□ 2.72
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PXDC1-202ENST00000380283 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa32.03■■■□□ 2.72
PXDC1-202ENST00000380283 PKNOX2Q96KN3 472 aa32.02■■■□□ 2.72
PXDC1-202ENST00000380283 SPG7Q9UQ90 795 aa32.02■■■□□ 2.72
PXDC1-202ENST00000380283 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
PXDC1-202ENST00000380283 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa32.02■■■□□ 2.72
PXDC1-202ENST00000380283 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
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PXDC1-202ENST00000380283 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.72
PXDC1-202ENST00000380283 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa32.01■■■□□ 2.72
PXDC1-202ENST00000380283 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.72
PXDC1-202ENST00000380283 CHAMP1Q96JM3 812 aa32.01■■■□□ 2.72
PXDC1-202ENST00000380283 TSPYL4Q9UJ04 414 aa32.01■■■□□ 2.71
PXDC1-202ENST00000380283 MAP7D2Q96T17 732 aa32■■■□□ 2.71
PXDC1-202ENST00000380283 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
PXDC1-202ENST00000380283 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa31.99■■■□□ 2.71
PXDC1-202ENST00000380283 LRRC37A3O60309 1634 aa31.99■■■□□ 2.71
PXDC1-202ENST00000380283 MCCP23508 829 aa31.99■■■□□ 2.71
PXDC1-202ENST00000380283 RNMTO43148 476 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
PXDC1-202ENST00000380283 GNAI2P04899 355 aa31.96■■■□□ 2.71
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