RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
NME1-NME2-201ENST00000376392 BTG4Q9NY30 223 aa16.24■□□□□ 0.19
NME1-NME2-201ENST00000376392 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
NME1-NME2-201ENST00000376392 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
NME1-NME2-201ENST00000376392 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP16.23■□□□□ 0.19
NME1-NME2-201ENST00000376392 SLC39A6Q13433 755 aa16.22■□□□□ 0.19
NME1-NME2-201ENST00000376392 NRAPQ86VF7 1730 aa16.22■□□□□ 0.19
NME1-NME2-201ENST00000376392 NWD2Q9ULI1 1742 aa16.22■□□□□ 0.19
NME1-NME2-201ENST00000376392 ALDH1L1O75891 902 aa16.21■□□□□ 0.19
NME1-NME2-201ENST00000376392 KSR2Q6VAB6 950 aa16.21■□□□□ 0.19
NME1-NME2-201ENST00000376392 LRP6O75581 1613 aa16.2■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa16.2■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 PI4KAP2A4QPH2 592 aa16.2■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa16.2■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 ADCY9O60503 1353 aa16.2■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 ERBB4Q15303 1308 aa16.19■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 GLI3P10071 1580 aa16.19■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 BEND3Q5T5X7 828 aa16.19■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 DISP2A7MBM2 1401 aa16.19■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 ITGB4P16144 1822 aa16.18■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 ANXA1P04083 346 aa16.18■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 ATP8B2P98198 1209 aa16.18■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 BMP2KLQ5H9B9 411 aa16.18■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 USP44Q9H0E7 712 aa16.18■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa16.18■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa16.17■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 NEXNQ0ZGT2 675 aa16.17■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 USP35Q9P2H5 1018 aa16.17■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa16.17■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 KCPQ6ZWJ8 1503 aa16.16■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 PROSER3Q2NL68 480 aa16.16■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 LINS1Q8NG48 757 aa16.16■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMOD3Q9NYL9 352 aa16.16■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 TNS2Q63HR2 1409 aa16.15■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 RIC3Q7Z5B4 369 aa16.15■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 MSH5O43196 834 aa16.14■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 PIP4K2BP78356 416 aa16.14■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 PDIA6Q15084 440 aa16.14■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 MYL6BP14649 208 aa16.13■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 XAGE3Q8WTP9 111 aa16.13■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 EXOC5O00471 708 aa16.12■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 RAB11FIP3O75154 756 aa16.12■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa16.12■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa16.12■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 SSH3Q8TE77 659 aa16.12■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 LRRCC1Q9C099 1032 aa16.12■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 USP16Q9Y5T5 823 aa16.12■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 NUP188Q5SRE5 1749 aa16.11■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 DOT1LQ8TEK3 1739 aa16.11■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 UBAP1LF5GYI3 381 aa16.11■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 ADAMTS2O95450 1211 aa16.11■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 COPS6Q7L5N1 327 aa16.11■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa16.1■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 APBB1O00213 710 aa16.1■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 GRM8O00222 908 aa16.1■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 CDC45O75419 566 aa16.1■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 POLA2Q14181 598 aa16.1■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 TTC22Q5TAA0 569 aa16.1■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa16.1■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa16.1■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 SRGAP3O43295 1099 aa16.09■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 CASC1Q6TDU7 716 aa16.09■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa16.09■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 UTYO14607 1347 aa16.09■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa16.09■□□□□ 0.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NME1-NME2-201ENST00000376392 SEC24BO95487 1268 aa16.08■□□□□ 0.16
NME1-NME2-201ENST00000376392 MTX1Q13505 466 aa16.08■□□□□ 0.16
NME1-NME2-201ENST00000376392 VSIG10Q8N0Z9 540 aa16.08■□□□□ 0.16
NME1-NME2-201ENST00000376392 PLBD2Q8NHP8 589 aa16.08■□□□□ 0.16
NME1-NME2-201ENST00000376392 TBC1D32Q96NH3 1257 aa16.08■□□□□ 0.16
NME1-NME2-201ENST00000376392 MYD88Q99836 296 aa16.08■□□□□ 0.16
NME1-NME2-201ENST00000376392 JCADQ9P266 1359 aa16.08■□□□□ 0.16
NME1-NME2-201ENST00000376392 SLIT2O94813 1529 aa16.08■□□□□ 0.16
NME1-NME2-201ENST00000376392 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NME1-NME2-201ENST00000376392 BECN1Q14457 450 aa16.07■□□□□ 0.16
NME1-NME2-201ENST00000376392 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NME1-NME2-201ENST00000376392 AOX1Q06278 1338 aa16.06■□□□□ 0.16
NME1-NME2-201ENST00000376392 NEURL1BA8MQ27 555 aa16.06■□□□□ 0.16
NME1-NME2-201ENST00000376392 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
NME1-NME2-201ENST00000376392 SURF6O75683 361 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
NME1-NME2-201ENST00000376392 LRP10Q7Z4F1 713 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms