RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376303.6

SYP-202, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-202ENST00000376303 DDR1Q08345 913 aa23.59■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.59■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 NARFQ9UHQ1 456 aa23.59■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 COL15A1P39059 1388 aa23.59■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.59■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 STARD3NLO95772 234 aa23.58■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 ZNF790Q6PG37 636 aa23.58■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.58■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.57■■□□□ 1.36
SYP-202ENST00000376303 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SYP-202ENST00000376303 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SYP-202ENST00000376303 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SYP-202ENST00000376303 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.56■■□□□ 1.36
SYP-202ENST00000376303 FCHSD2O94868 740 aa23.56■■□□□ 1.36
SYP-202ENST00000376303 KCNA3P22001 575 aa23.56■■□□□ 1.36
SYP-202ENST00000376303 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SYP-202ENST00000376303 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.55■■□□□ 1.36
SYP-202ENST00000376303 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SYP-202ENST00000376303 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
SYP-202ENST00000376303 PIM2Q9P1W9 311 aa23.55■■□□□ 1.36
SYP-202ENST00000376303 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SYP-202ENST00000376303 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.53■■□□□ 1.36
SYP-202ENST00000376303 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.53■■□□□ 1.36
SYP-202ENST00000376303 A0A087WZG4 1122 aa23.52■■□□□ 1.36
SYP-202ENST00000376303 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SYP-202ENST00000376303 NFIXQ14938 502 aa23.52■■□□□ 1.36
SYP-202ENST00000376303 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.52■■□□□ 1.36
SYP-202ENST00000376303 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SYP-202ENST00000376303 BTBD11A6QL63 1104 aa23.51■■□□□ 1.35
SYP-202ENST00000376303 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.51■■□□□ 1.35
SYP-202ENST00000376303 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SYP-202ENST00000376303 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SYP-202ENST00000376303 SERPINB2P05120 415 aa23.48■■□□□ 1.35
SYP-202ENST00000376303 CHRNA5P30532 468 aa23.48■■□□□ 1.35
SYP-202ENST00000376303 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SYP-202ENST00000376303 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SYP-202ENST00000376303 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SYP-202ENST00000376303 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.45■■□□□ 1.34
SYP-202ENST00000376303 SCN7AQ01118 1682 aa23.45■■□□□ 1.34
SYP-202ENST00000376303 KCNQ3O43525 872 aa23.45■■□□□ 1.34
SYP-202ENST00000376303 MCM10Q7L590 875 aa23.45■■□□□ 1.34
SYP-202ENST00000376303 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SYP-202ENST00000376303 SBF1O95248 1867 aa23.44■■□□□ 1.34
SYP-202ENST00000376303 A1BGP04217 495 aa23.43■■□□□ 1.34
SYP-202ENST00000376303 NEFMP07197 916 aa23.43■■□□□ 1.34
SYP-202ENST00000376303 BICDL1Q6ZP65 573 aa23.43■■□□□ 1.34
SYP-202ENST00000376303 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.43■■□□□ 1.34
SYP-202ENST00000376303 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.43■■□□□ 1.34
SYP-202ENST00000376303 KIF3CO14782 793 aa23.41■■□□□ 1.34
SYP-202ENST00000376303 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.41■■□□□ 1.34
SYP-202ENST00000376303 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.41■■□□□ 1.34
SYP-202ENST00000376303 USP16Q9Y5T5 823 aa23.41■■□□□ 1.34
SYP-202ENST00000376303 CEP350Q5VT06 3117 aa23.41■■□□□ 1.34
SYP-202ENST00000376303 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SYP-202ENST00000376303 DCTN1Q14203 1278 aa23.4■■□□□ 1.34
SYP-202ENST00000376303 BCORQ6W2J9 1755 aa23.39■■□□□ 1.33
SYP-202ENST00000376303 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.39■■□□□ 1.33
SYP-202ENST00000376303 H0YIN7 160 aa23.38■■□□□ 1.33
SYP-202ENST00000376303 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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SYP-202ENST00000376303 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SYP-202ENST00000376303 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.37■■□□□ 1.33
SYP-202ENST00000376303 TTLL6Q8N841 843 aa23.37■■□□□ 1.33
SYP-202ENST00000376303 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.37■■□□□ 1.33
SYP-202ENST00000376303 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.36■■□□□ 1.33
SYP-202ENST00000376303 SETDB2Q96T68 719 aa23.36■■□□□ 1.33
SYP-202ENST00000376303 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.36■■□□□ 1.33
SYP-202ENST00000376303 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SYP-202ENST00000376303 RNF181Q9P0P0 153 aa23.36■■□□□ 1.33
SYP-202ENST00000376303 HSPA6P17066 643 aa23.35■■□□□ 1.33
SYP-202ENST00000376303 PDE6BP35913 854 aa23.35■■□□□ 1.33
SYP-202ENST00000376303 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.35■■□□□ 1.33
SYP-202ENST00000376303 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.35■■□□□ 1.33
SYP-202ENST00000376303 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.34■■□□□ 1.33
SYP-202ENST00000376303 TOMM70O94826 608 aa23.33■■□□□ 1.33
SYP-202ENST00000376303 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SYP-202ENST00000376303 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.33■■□□□ 1.33
SYP-202ENST00000376303 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
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SYP-202ENST00000376303 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.32■■□□□ 1.32
SYP-202ENST00000376303 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.32■■□□□ 1.32
SYP-202ENST00000376303 NPHP1O15259 732 aa23.31■■□□□ 1.32
SYP-202ENST00000376303 RALBP1Q15311 655 aa23.31■■□□□ 1.32
SYP-202ENST00000376303 NFE2L2Q16236 605 aa23.31■■□□□ 1.32
SYP-202ENST00000376303 CNBD1Q8NA66 436 aa23.31■■□□□ 1.32
SYP-202ENST00000376303 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.31■■□□□ 1.32
SYP-202ENST00000376303 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.31■■□□□ 1.32
SYP-202ENST00000376303 RGL2O15211 777 aa23.3■■□□□ 1.32
SYP-202ENST00000376303 ST5P78524 1137 aa23.3■■□□□ 1.32
SYP-202ENST00000376303 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
SYP-202ENST00000376303 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.3■■□□□ 1.32
SYP-202ENST00000376303 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SYP-202ENST00000376303 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.3■■□□□ 1.32
SYP-202ENST00000376303 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SYP-202ENST00000376303 NBPF26B4DH59 902 aa23.29■■□□□ 1.32
SYP-202ENST00000376303 LMNB1P20700 586 aa23.29■■□□□ 1.32
SYP-202ENST00000376303 RASSF7Q02833 373 aa23.29■■□□□ 1.32
SYP-202ENST00000376303 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
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