RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 GGA1Q9UJY5 639 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 A6NJY4 79 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 NBPF1Q3BBV0 1214 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 FAM182BQ5T319 152 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 COG6Q9Y2V7 657 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRK-202ENST00000368205 EPXP11678 715 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 AIDAQ96BJ3 306 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 SERTAD1Q9UHV2 236 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 A0A1W2PNR3 127 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 PIK3CDO00329 1044 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 COL8A1P27658 744 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 EML3Q32P44 896 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 ALG2Q9H553 416 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 RRAGCQ9HB90 399 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 KRBA1A5PL33 1030 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 PIK3R2O00459 728 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 TATP17735 454 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 TNP2Q05952 138 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 USP3Q9Y6I4 520 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 BACH1O14867 736 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 FAM157BP0CG42 384 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 MAPTP10636 758 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 AMPD1P23109 780 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 BTBD6Q96KE9 485 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 ZIC5Q96T25 663 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 HCN2Q9UL51 889 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 NOD1Q9Y239 953 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 ADAM23O75077 832 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 CABP1Q9NZU7 370 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 GNB5O14775 395 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 SKIP12755 728 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 ADH6P28332 368 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 DGKGP49619 791 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 GTF2IP78347 998 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
PTPRK-202ENST00000368205 WWC1Q8IX03 1113 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 CD33P20138 364 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 NCOA4Q13772 614 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 SUV39H2Q9H5I1 410 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF358Q9NW07 568 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 KLF15Q9UIH9 416 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 EFSO43281 561 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 EPHA4P54764 986 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 LAMC2Q13753 1193 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 GRIN2CQ14957 1233 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 GJA3Q9Y6H8 435 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 TEAD4Q15561 434 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 CHSY3Q70JA7 882 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 USP17L5A8MUK1 530 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 TXLNAP40222 546 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 BAG6P46379 1132 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 EML1O00423 815 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 PSME1Q06323 249 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 POM121Q96HA1 1249 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 MARK1Q9P0L2 795 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 PARP3Q9Y6F1 533 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRK-202ENST00000368205 NOS2P35228 1153 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 RAD21O60216 631 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 TRIM50Q86XT4 487 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 C7orf43Q8WVR3 580 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 STRN4Q9NRL3 753 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 MDFIQ99750 246 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 FLIIQ13045 1269 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 ATP1A2P50993 1020 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 ELOA3BQ3SY89 546 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 POTEAQ6S8J7 498 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 CD163Q86VB7 1156 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 TNS4Q8IZW8 715 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRK-202ENST00000368205 ELOA3Q8NG57 546 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms