RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 KIF5CO60282 957 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 TMPOP42166 694 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 MYZAPP0CAP1 466 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 KDM5BQ9UGL1 1544 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 AMPD3Q01432 767 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 IQCA1Q86XH1 822 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 NEBLO76041 1014 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 NEFHP12036 1026 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 TTLL5Q6EMB2 1281 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 UBXN4Q92575 508 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 ATP2B1P20020 1258 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 NAPBQ9H115 298 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 KIF18AQ8NI77 898 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 DMRT2Q9Y5R5 561 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 TUBB4BP68371 445 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 ATP2B2Q01814 1243 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 ZFYVE9O95405 1425 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 CRACR2AQ9BSW2 395 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 CFAP74Q9C0B2 1584 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 USO1O60763 962 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 PLVAPQ9BX97 442 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 STAMBPO95630 424 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 SLFN5Q08AF3 891 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 CFAP100Q494V2 611 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 YEATS4O95619 227 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 METTL24Q5JXM2 366 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 MICALCLQ6ZW33 695 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 ZSCAN30Q86W11 494 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 SHTN1A0MZ66 631 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 PDE4BQ07343 736 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 EVI5LQ96CN4 794 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 STX1AQ16623 288 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 SLC12A7Q9Y666 1083 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 BAG3O95817 575 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 GSTO1P78417 241 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 BMP2KLQ5H9B9 411 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 SIL1Q9H173 461 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 MYL6BP14649 208 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 ERMNQ8TAM6 284 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 C8orf76Q96K31 380 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 NF2P35240 595 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 RMND1Q9NWS8 449 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 NBPF1Q3BBV0 1214 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 ABCC5O15440 1437 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 HOOK3Q86VS8 718 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 USP5P45974 858 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGAP45Q92619 1136 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 TMCO3Q6UWJ1 677 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 MAST1Q9Y2H9 1570 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 PRPHP41219 470 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 LUZP1Q86V48 1076 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 CTAGE1Q96RT6 745 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 MTMR7Q9Y216 660 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 ESPNB1AK53 854 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 IDH1O75874 414 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 DNAAF4Q8WXU2 420 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 MCM4P33991 863 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 LDHCP07864 332 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
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