RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 MIPOL1Q8TD10 442 aa5.72□□□□□ -1.49
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PTPRD-201ENST00000355233 RAB34Q9BZG1 259 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRD-201ENST00000355233 USO1O60763 962 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRD-201ENST00000355233 KLHL40Q2TBA0 621 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRD-201ENST00000355233 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRD-201ENST00000355233 TSGA10Q9BZW7 698 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRD-201ENST00000355233 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRD-201ENST00000355233 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRD-201ENST00000355233 NAIPQ13075 1403 aa5.72□□□□□ -1.49
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PTPRD-201ENST00000355233 BABAM1Q9NWV8 329 aa5.72□□□□□ -1.49
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PTPRD-201ENST00000355233 UQCRHP07919 91 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC181Q5TID7 509 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 IMPACTQ9P2X3 320 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRD-201ENST00000355233 DUSP27Q5VZP5 1158 aa5.69□□□□□ -1.5
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