RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354833.7

SERF1A-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1A, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1A-202ENST00000354833 PLCH1Q4KWH8 1693 aa30.38■■■□□ 2.45
SERF1A-202ENST00000354833 ADAMTS2O95450 1211 aa30.38■■■□□ 2.45
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SERF1A-202ENST00000354833 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.36■■■□□ 2.45
SERF1A-202ENST00000354833 GLI3P10071 1580 aa30.36■■■□□ 2.45
SERF1A-202ENST00000354833 USP16Q9Y5T5 823 aa30.35■■■□□ 2.45
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SERF1A-202ENST00000354833 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
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SERF1A-202ENST00000354833 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
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SERF1A-202ENST00000354833 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa30.28■■■□□ 2.44
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SERF1A-202ENST00000354833 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
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SERF1A-202ENST00000354833 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
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SERF1A-202ENST00000354833 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa30.25■■■□□ 2.43
SERF1A-202ENST00000354833 SLIT2O94813 1529 aa30.25■■■□□ 2.43
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SERF1A-202ENST00000354833 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
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SERF1A-202ENST00000354833 NBPF26B4DH59 902 aa30.17■■■□□ 2.42
SERF1A-202ENST00000354833 UTYO14607 1347 aa30.17■■■□□ 2.42
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SERF1A-202ENST00000354833 NBPF14Q5TI25 921 aa30.17■■■□□ 2.42
SERF1A-202ENST00000354833 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
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SERF1A-202ENST00000354833 NBPF15Q8N660 670 aa30.17■■■□□ 2.42
SERF1A-202ENST00000354833 BCL9O00512 1426 aa30.17■■■□□ 2.42
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SERF1A-202ENST00000354833 ITGB4P16144 1822 aa30.15■■■□□ 2.42
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SERF1A-202ENST00000354833 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
SERF1A-202ENST00000354833 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
SERF1A-202ENST00000354833 GCKRQ14397 625 aa30.1■■■□□ 2.41
SERF1A-202ENST00000354833 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
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SERF1A-202ENST00000354833 TTC22Q5TAA0 569 aa30.09■■■□□ 2.41
SERF1A-202ENST00000354833 BCL11AQ9H165 835 aa30.09■■■□□ 2.41
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