RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa18.42■□□□□ 0.54
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PTPRU-201ENST00000345512 PDCL2Q8N4E4 241 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 UNC13BO14795 1591 aa18.41■□□□□ 0.54
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PTPRU-201ENST00000345512 NECAB1Q8N987 351 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 SMC2O95347 1197 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM63CQ9P1W3 806 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 SIRT2Q8IXJ6 389 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 PLXNC1O60486 1568 aa18.4■□□□□ 0.54
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PTPRU-201ENST00000345512 CFAP45Q9UL16 551 aa18.39■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa18.39■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 PIK3R4Q99570 1358 aa18.39■□□□□ 0.54
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PTPRU-201ENST00000345512 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.38■□□□□ 0.53
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PTPRU-201ENST00000345512 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa18.35■□□□□ 0.53
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PTPRU-201ENST00000345512 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
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PTPRU-201ENST00000345512 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRU-201ENST00000345512 EYA1Q99502 592 aa18.35■□□□□ 0.53
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PTPRU-201ENST00000345512 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa18.33■□□□□ 0.53
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PTPRU-201ENST00000345512 MAP3K19Q56UN5 1328 aa18.33■□□□□ 0.52
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PTPRU-201ENST00000345512 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 PALD1Q9ULE6 856 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 RASSF8Q8NHQ8 419 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 LAMC1P11047 1609 aa18.31■□□□□ 0.52
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PTPRU-201ENST00000345512 TNNT1P13805 278 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
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PTPRU-201ENST00000345512 KIF24Q5T7B8 1368 aa18.3■□□□□ 0.52
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PTPRU-201ENST00000345512 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 GUCY1B3Q02153 619 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa18.3■□□□□ 0.52
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PTPRU-201ENST00000345512 OLFM4Q6UX06 510 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 ERBB4Q15303 1308 aa18.3■□□□□ 0.52
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PTPRU-201ENST00000345512 DACT1Q9NYF0 836 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 PPFIA3O75145 1194 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 FAM200AQ8TCP9 573 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 MYD88Q99836 296 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 FLT4P35916 1363 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF853P0CG23 659 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 TATP17735 454 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC186Q7Z3E2 898 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 TTC21AQ8NDW8 1320 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 KIF1BO60333 1816 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 TET3O43151 1660 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 SPDYE4A6NLX3 237 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 PTPN14Q15678 1187 aa18.28■□□□□ 0.52
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