RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
SNX18-201ENST00000326277 SLC39A6Q13433 755 aa28.25■■■□□ 2.11
SNX18-201ENST00000326277 HSCBQ8IWL3 235 aa28.25■■■□□ 2.11
SNX18-201ENST00000326277 SALL3Q9BXA9 1300 aa28.25■■■□□ 2.11
SNX18-201ENST00000326277 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.24■■■□□ 2.11
SNX18-201ENST00000326277 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa28.24■■■□□ 2.11
SNX18-201ENST00000326277 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.23■■■□□ 2.11
SNX18-201ENST00000326277 SLAIN2Q9P270 581 aa28.23■■■□□ 2.11
SNX18-201ENST00000326277 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.23■■■□□ 2.11
SNX18-201ENST00000326277 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
SNX18-201ENST00000326277 SNX21Q969T3 373 aa28.23■■■□□ 2.11
SNX18-201ENST00000326277 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.23■■■□□ 2.11
SNX18-201ENST00000326277 CYP27B1O15528 508 aa28.22■■■□□ 2.11
SNX18-201ENST00000326277 HYPKQ9NX55 129 aa28.22■■■□□ 2.11
SNX18-201ENST00000326277 POLA2Q14181 598 aa28.22■■■□□ 2.11
SNX18-201ENST00000326277 KSR2Q6VAB6 950 aa28.22■■■□□ 2.11
SNX18-201ENST00000326277 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
SNX18-201ENST00000326277 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.2■■■□□ 2.11
SNX18-201ENST00000326277 TSHZ3Q63HK5 1081 aa28.2■■■□□ 2.1
SNX18-201ENST00000326277 CASC1Q6TDU7 716 aa28.2■■■□□ 2.1
SNX18-201ENST00000326277 DCAF5Q96JK2 942 aa28.2■■■□□ 2.1
SNX18-201ENST00000326277 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.2■■■□□ 2.1
SNX18-201ENST00000326277 MX1P20591 662 aa28.19■■■□□ 2.1
SNX18-201ENST00000326277 PDIA6Q15084 440 aa28.19■■■□□ 2.1
SNX18-201ENST00000326277 C5P01031 1676 aa28.18■■■□□ 2.1
SNX18-201ENST00000326277 SRGAP3O43295 1099 aa28.18■■■□□ 2.1
SNX18-201ENST00000326277 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.18■■■□□ 2.1
SNX18-201ENST00000326277 ALDH1L1O75891 902 aa28.17■■■□□ 2.1
SNX18-201ENST00000326277 MRC1P22897 1456 aa28.17■■■□□ 2.1
SNX18-201ENST00000326277 SURF6O75683 361 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
SNX18-201ENST00000326277 USP26Q9BXU7 913 aa28.16■■■□□ 2.1
SNX18-201ENST00000326277 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
SNX18-201ENST00000326277 RAB11FIP3O75154 756 aa28.15■■■□□ 2.1
SNX18-201ENST00000326277 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
SNX18-201ENST00000326277 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
SNX18-201ENST00000326277 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
SNX18-201ENST00000326277 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa28.14■■■□□ 2.1
SNX18-201ENST00000326277 STAP2Q9UGK3 403 aa28.14■■■□□ 2.1
SNX18-201ENST00000326277 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.14■■■□□ 2.1
SNX18-201ENST00000326277 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa28.13■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 TTC5Q8N0Z6 440 aa28.12■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.11■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 LINS1Q8NG48 757 aa28.11■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 RHPN1Q8TCX5 695 aa28.11■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 MTX1Q13505 466 aa28.11■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 MYL6BP14649 208 aa28.1■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 CABP4P57796 275 aa28.1■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 CHMP5Q9NZZ3 219 aa28.09■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 ERC2O15083 957 aa28.09■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 REC8O95072 547 aa28.09■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 KIF1BPQ96EK5 621 aa28.09■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.08■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 USP16Q9Y5T5 823 aa28.08■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 AOX1Q06278 1338 aa28.08■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 ABCA3Q99758 1704 aa28.08■■■□□ 2.09
SNX18-201ENST00000326277 FMNL2Q96PY5 1086 aa28.07■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.07■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 GRM8O00222 908 aa28.06■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.06■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa28.06■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa28.06■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 HDAC5Q9UQL6 1122 aa28.06■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 UTYO14607 1347 aa28.06■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 DDIT3P35638 169 aa28.05■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 RABEP1Q15276 862 aa28.05■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 COPS6Q7L5N1 327 aa28.05■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 RILPL2Q969X0 211 aa28.05■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.05■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.05■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 IGKV5-2P06315 115 aa28.04■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.04■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.03■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 SUCLG2Q96I99 432 aa28.03■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 CHMLP26374 656 aa28.02■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 KAZALD1Q96I82 304 aa28.02■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa28.02■■■□□ 2.08
SNX18-201ENST00000326277 GSE1Q14687 1217 aa28.01■■■□□ 2.07
SNX18-201ENST00000326277 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.01■■■□□ 2.07
SNX18-201ENST00000326277 GLI3P10071 1580 aa28.01■■■□□ 2.07
SNX18-201ENST00000326277 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.01■■■□□ 2.07
SNX18-201ENST00000326277 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
SNX18-201ENST00000326277 PI4K2BQ8TCG2 481 aa28.01■■■□□ 2.07
SNX18-201ENST00000326277 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.01■■■□□ 2.07
SNX18-201ENST00000326277 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
SNX18-201ENST00000326277 NEURL1BA8MQ27 555 aa27.99■■■□□ 2.07
SNX18-201ENST00000326277 IL2RBP14784 551 aa27.99■■■□□ 2.07
SNX18-201ENST00000326277 STRN4Q9NRL3 753 aa27.99■■■□□ 2.07
SNX18-201ENST00000326277 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.99■■■□□ 2.07
SNX18-201ENST00000326277 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
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