RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 ANO2Q9NQ90 1003 aa19.99■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 SRGAP3O43295 1099 aa19.99■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 GCP02774 474 aa19.99■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 MCTP1Q6DN14 999 aa19.99■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 BEND3Q5T5X7 828 aa19.98■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 CHAMP1Q96JM3 812 aa19.98■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa19.98■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 NUCB2P80303 420 aa19.98■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 AKAP4Q5JQC9 854 aa19.98■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 DNAAF4Q8WXU2 420 aa19.98■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 KDM3BQ7LBC6 1761 aa19.97■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 GOLGA6L22H0YM25 854 aa19.97■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 POLA2Q14181 598 aa19.97■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 ZDHHC9Q9Y397 364 aa19.97■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 PXDNQ92626 1479 aa19.96■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa19.96■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 RHPN1Q8TCX5 695 aa19.96■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 ARHGEF25Q86VW2 580 aa19.96■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 AXIN2Q9Y2T1 843 aa19.96■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 PROSER3Q2NL68 480 aa19.95■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 TMX3Q96JJ7 454 aa19.95■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 ADCY9O60503 1353 aa19.95■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 PTMSP20962 102 aa19.95■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 RNMTO43148 476 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 FGD1P98174 961 aa19.94■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 ANKRD24Q8TF21 1146 aa19.94■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 HOXB7P09629 217 aa19.93■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 LMO7Q8WWI1 1683 aa19.93■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 KLHL40Q2TBA0 621 aa19.93■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 C1orf141Q5JVX7 400 aa19.93■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 PI4K2BQ8TCG2 481 aa19.93■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 RAB11FIP3O75154 756 aa19.93■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 LMBRD1Q9NUN5 540 aa19.92■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 NCLP19338 710 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 MCCP23508 829 aa19.91■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa19.91■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 AMOTQ4VCS5 1084 aa19.91■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 KIF1BPQ96EK5 621 aa19.9■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 AOX1Q06278 1338 aa19.9■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.78
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 PDE4CQ08493 712 aa19.89■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 ANAPC15P60006 121 aa19.88■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 KRT28Q7Z3Y7 464 aa19.88■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 RGPD5Q99666 1765 aa19.87■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 HSPA4P34932 840 aa19.85■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 CUL4AQ13619 759 aa19.85■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 KSR2Q6VAB6 950 aa19.85■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 GPT2Q8TD30 523 aa19.85■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 SLIT3O75094 1523 aa19.85■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 CLCN1P35523 988 aa19.85■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 MCM2P49736 904 aa19.85■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 SGSM2O43147 1006 aa19.85■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 SLC39A6Q13433 755 aa19.85■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 CHMP4AQ9BY43 222 aa19.85■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 NCAPD2Q15021 1401 aa19.84■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 HEG1Q9ULI3 1381 aa19.84■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 SPG7Q9UQ90 795 aa19.84■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa19.83■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 CNTROBQ8N137 903 aa19.83■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
SHQ1-201ENST00000325599 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 MTX1Q13505 466 aa19.82■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa19.82■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 RASEFQ8IZ41 740 aa19.82■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 IL17RAQ96F46 866 aa19.82■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 KAZALD1Q96I82 304 aa19.81■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 RAD50Q92878 1312 aa19.81■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 ALDH1L1O75891 902 aa19.81■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 BRD1O95696 1058 aa19.81■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 SNX14Q9Y5W7 946 aa19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms