RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 PI4K2BQ8TCG2 481 aa30.49■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 TTC14Q96N46 770 aa30.49■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 TECPR2O15040 1411 aa30.49■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 SYT1P21579 422 aa30.49■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 CCDC183Q5T5S1 534 aa30.49■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 FIBPO43427 364 aa30.48■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 SURF6O75683 361 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa30.48■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 TMEM87AQ8NBN3 555 aa30.48■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 USP31Q70CQ4 1352 aa30.48■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 SPG7Q9UQ90 795 aa30.47■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 SGSM2O43147 1006 aa30.47■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 RAD50Q92878 1312 aa30.47■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 SIRT1Q96EB6 747 aa30.47■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP30.46■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 PIBF1Q8WXW3 757 aa30.46■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 AP5Z1O43299 807 aa30.46■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 PLEKHG3A1L390 1219 aa30.45■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 GIMAP6Q6P9H5 292 aa30.45■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 SSH3Q8TE77 659 aa30.45■■■□□ 2.47
SENP3-201ENST00000321337 STX6O43752 255 aa30.45■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 MYRIPQ8NFW9 859 aa30.45■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 PRDM4Q9UKN5 801 aa30.45■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 PLCB2Q00722 1185 aa30.44■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 UVSSAQ2YD98 709 aa30.44■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 FAM184AQ8NB25 1140 aa30.43■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 IL17REQ8NFR9 667 aa30.43■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 RHPN1Q8TCX5 695 aa30.43■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 PRDM10Q9NQV6 1147 aa30.43■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 KDRP35968 1356 aa30.43■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 ZNF710Q8N1W2 664 aa30.43■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 AMPHP49418 695 aa30.42■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.42■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 AOX1Q06278 1338 aa30.42■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 IGSF1Q8N6C5 1336 aa30.42■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 F13A1P00488 732 aa30.42■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 UBE2HP62256 183 aa30.41■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa30.4■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 FLT4P35916 1363 aa30.39■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 SRGAP3O43295 1099 aa30.39■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 CCDC83Q8IWF9 413 aa30.39■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 FUCA2Q9BTY2 467 aa30.39■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 SMC3Q9UQE7 1217 aa30.39■■■□□ 2.46
SENP3-201ENST00000321337 GNAT3A8MTJ3 354 aa30.39■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 KDM4AO75164 1064 aa30.39■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 CASTP20810 708 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 ADCK5Q3MIX3 580 aa30.39■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 POLA2Q14181 598 aa30.38■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.38■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 SBNO1A3KN83 1393 aa30.37■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 PTH1RQ03431 593 aa30.37■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.37■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 NUTM2GQ5VZR2 741 aa30.36■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 GJB2P29033 226 aa30.36■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa30.36■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 HYPKQ9NX55 129 aa30.36■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 ST3GAL1Q11201 340 aa30.35■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 KCNF1Q9H3M0 494 aa30.35■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa30.34■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 PYCARDQ9ULZ3 195 aa30.34■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 MTMR6Q9Y217 621 aa30.34■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.34■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 RAB11FIP3O75154 756 aa30.33■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 CNTROBQ8N137 903 aa30.33■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 SPC24Q8NBT2 197 aa30.33■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.33■■■□□ 2.45
SENP3-201ENST00000321337 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
SENP3-201ENST00000321337 SPTLC3Q9NUV7 552 aa30.32■■■□□ 2.44
SENP3-201ENST00000321337 AGLP35573 1532 aa30.32■■■□□ 2.44
SENP3-201ENST00000321337 ANXA1P04083 346 aa30.32■■■□□ 2.44
SENP3-201ENST00000321337 USHBP1Q8N6Y0 703 aa30.32■■■□□ 2.44
SENP3-201ENST00000321337 NECAB1Q8N987 351 aa30.32■■■□□ 2.44
SENP3-201ENST00000321337 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
SENP3-201ENST00000321337 KIF1BPQ96EK5 621 aa30.31■■■□□ 2.44
SENP3-201ENST00000321337 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
SENP3-201ENST00000321337 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.31■■■□□ 2.44
SENP3-201ENST00000321337 CHMP3Q9Y3E7 222 aa30.31■■■□□ 2.44
SENP3-201ENST00000321337 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
SENP3-201ENST00000321337 PRIMPOLQ96LW4 560 aa30.31■■■□□ 2.44
SENP3-201ENST00000321337 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
SENP3-201ENST00000321337 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
SENP3-201ENST00000321337 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
SENP3-201ENST00000321337 FAM173BQ6P4H8 233 aa30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms