RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317378.5

TRAPPC5-201, Transcript of trafficking protein particle complex 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC5, Length 790 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5-201ENST00000317378 RSPH6AQ9H0K4 717 aa27.39■■□□□ 1.98
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TRAPPC5-201ENST00000317378 PHACTR3Q96KR7 559 aa27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC5-201ENST00000317378 COL15A1P39059 1388 aa27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC5-201ENST00000317378 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC5-201ENST00000317378 ZNF790Q6PG37 636 aa27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC5-201ENST00000317378 FCHSD2O94868 740 aa27.36■■□□□ 1.97
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TRAPPC5-201ENST00000317378 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.36■■□□□ 1.97
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TRAPPC5-201ENST00000317378 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
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TRAPPC5-201ENST00000317378 A0A087WZG4 1122 aa27.29■■□□□ 1.96
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TRAPPC5-201ENST00000317378 FMNL2Q96PY5 1086 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC5-201ENST00000317378 NRXN2Q9P2S2 1712 aa27.29■■□□□ 1.96
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TRAPPC5-201ENST00000317378 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
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TRAPPC5-201ENST00000317378 CEP350Q5VT06 3117 aa27.23■■□□□ 1.95
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TRAPPC5-201ENST00000317378 C9orf131Q5VYM1 1079 aa27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC5-201ENST00000317378 MCM10Q7L590 875 aa27.2■■□□□ 1.94
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TRAPPC5-201ENST00000317378 USP16Q9Y5T5 823 aa27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC5-201ENST00000317378 HSPA6P17066 643 aa27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC5-201ENST00000317378 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC5-201ENST00000317378 CAMTA2O94983 1202 aa27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC5-201ENST00000317378 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC5-201ENST00000317378 SCN7AQ01118 1682 aa27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC5-201ENST00000317378 DLEC1Q9Y238 1755 aa27.16■■□□□ 1.94
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TRAPPC5-201ENST00000317378 RNF181Q9P0P0 153 aa27.13■■□□□ 1.93
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TRAPPC5-201ENST00000317378 PRELPP51888 382 aa27.07■■□□□ 1.92
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TRAPPC5-201ENST00000317378 LMNB1P20700 586 aa27.06■■□□□ 1.92
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TRAPPC5-201ENST00000317378 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC5-201ENST00000317378 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC5-201ENST00000317378 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC5-201ENST00000317378 ZNF652Q9Y2D9 606 aa27.02■■□□□ 1.92
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TRAPPC5-201ENST00000317378 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
TRAPPC5-201ENST00000317378 SRGNP10124 158 aa27■■□□□ 1.91
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