RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 ATG3Q9NT62 314 aa7.59□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 FBXO3Q9UK99 471 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 SLC39A6Q13433 755 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
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PDE4D-202ENST00000317118 ERBB4Q15303 1308 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 CCDC30Q5VVM6 783 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 POTEGQ6S5H5 508 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 LAMB4A4D0S4 1761 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 KRT24Q2M2I5 525 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 SSH1Q8WYL5 1049 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 ASAP1Q9ULH1 1129 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 KIF16BQ96L93 1317 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 KCNQ2O43526 872 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 ARHGAP45Q92619 1136 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 C5P01031 1676 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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PDE4D-202ENST00000317118 RRP1P56182 461 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 PALLDQ8WX93 1383 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 BTAF1O14981 1849 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 BCAR3O75815 825 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 STK31Q9BXU1 1019 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 SMC4Q9NTJ3 1288 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 PTPRCP08575 1304 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 MS4A1P11836 297 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 LY75O60449 1722 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 TJP1Q07157 1748 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 PDE3AQ14432 1141 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 RREB1Q92766 1687 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 SLC4A2P04920 1241 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 SIK1P57059 783 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 PDIA6Q15084 440 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 FAM182BQ5T319 152 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 HYPKQ9NX55 129 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 USP16Q9Y5T5 823 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 PLSCR1O15162 318 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 STARD3NLO95772 234 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-202ENST00000317118 CACNA1FO60840 1977 aa7.53□□□□□ -1.2
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PDE4D-202ENST00000317118 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 PTF1AQ7RTS3 328 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 LRP10Q7Z4F1 713 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 GABBR2O75899 941 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 ATP6V1AP38606 617 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 DNAJC10Q8IXB1 793 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 PXDNLA1KZ92 1463 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 ABCB7O75027 752 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 TRIM37O94972 964 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 FLIIQ13045 1269 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 TRIM27P14373 513 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 ITPK1Q13572 414 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 ABCC4O15439 1325 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 NBPF26B4DH59 902 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 DDX58O95786 925 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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PDE4D-202ENST00000317118 NBPF14Q5TI25 921 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 G2E3Q7L622 706 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 CCDC125Q86Z20 511 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 NBPF15Q8N660 670 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 RGL2O15211 777 aa7.5□□□□□ -1.21
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