RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 PALLDQ8WX93 1383 aa28.27■■■□□ 2.12
CTU2-201ENST00000312060 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.26■■■□□ 2.12
CTU2-201ENST00000312060 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.26■■■□□ 2.12
CTU2-201ENST00000312060 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.26■■■□□ 2.12
CTU2-201ENST00000312060 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.12
CTU2-201ENST00000312060 SLC4A9Q96Q91 983 aa28.26■■■□□ 2.11
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CTU2-201ENST00000312060 PDE3AQ14432 1141 aa28.25■■■□□ 2.11
CTU2-201ENST00000312060 G2E3Q7L622 706 aa28.25■■■□□ 2.11
CTU2-201ENST00000312060 DNAJC10Q8IXB1 793 aa28.24■■■□□ 2.11
CTU2-201ENST00000312060 EP400Q96L91 3159 aa28.24■■■□□ 2.11
CTU2-201ENST00000312060 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.23■■■□□ 2.11
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CTU2-201ENST00000312060 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.23■■■□□ 2.11
CTU2-201ENST00000312060 TNNQ9UQP3 1299 aa28.23■■■□□ 2.11
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CTU2-201ENST00000312060 MS4A1P11836 297 aa28.23■■■□□ 2.11
CTU2-201ENST00000312060 CLUAP1Q96AJ1 413 aa28.23■■■□□ 2.11
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CTU2-201ENST00000312060 TRIM37O94972 964 aa28.21■■■□□ 2.11
CTU2-201ENST00000312060 STARD3NLO95772 234 aa28.21■■■□□ 2.11
CTU2-201ENST00000312060 ATP6V1AP38606 617 aa28.21■■■□□ 2.11
CTU2-201ENST00000312060 PROSER3Q2NL68 480 aa28.21■■■□□ 2.11
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CTU2-201ENST00000312060 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.19■■■□□ 2.1
CTU2-201ENST00000312060 LY75O60449 1722 aa28.19■■■□□ 2.1
CTU2-201ENST00000312060 A1BGP04217 495 aa28.19■■■□□ 2.1
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CTU2-201ENST00000312060 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
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CTU2-201ENST00000312060 ITPK1Q13572 414 aa28.14■■■□□ 2.1
CTU2-201ENST00000312060 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
CTU2-201ENST00000312060 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.13■■■□□ 2.09
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CTU2-201ENST00000312060 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.08■■■□□ 2.09
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CTU2-201ENST00000312060 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.02■■■□□ 2.08
CTU2-201ENST00000312060 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa28.01■■■□□ 2.07
CTU2-201ENST00000312060 PLBD2Q8NHP8 589 aa28■■■□□ 2.07
CTU2-201ENST00000312060 LRRC4BQ9NT99 713 aa28■■■□□ 2.07
CTU2-201ENST00000312060 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
CTU2-201ENST00000312060 EIF5P55010 431 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
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