RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.5■■□□□ 1.83
MESP1-201ENST00000300057 ADCY9O60503 1353 aa26.49■■□□□ 1.83
MESP1-201ENST00000300057 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.49■■□□□ 1.83
MESP1-201ENST00000300057 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.48■■□□□ 1.83
MESP1-201ENST00000300057 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
MESP1-201ENST00000300057 BEND3Q5T5X7 828 aa26.48■■□□□ 1.83
MESP1-201ENST00000300057 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.48■■□□□ 1.83
MESP1-201ENST00000300057 RRP9O43818 475 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
MESP1-201ENST00000300057 RBM25P49756 843 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
MESP1-201ENST00000300057 ZNF790Q6PG37 636 aa26.47■■□□□ 1.83
MESP1-201ENST00000300057 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
MESP1-201ENST00000300057 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
MESP1-201ENST00000300057 CLCN1P35523 988 aa26.46■■□□□ 1.83
MESP1-201ENST00000300057 CYP27B1O15528 508 aa26.45■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 LRRCC1Q9C099 1032 aa26.44■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.44■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.44■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.43■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 SDSP20132 328 aa26.43■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 ZMYND15Q9H091 742 aa26.43■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 DCAF5Q96JK2 942 aa26.42■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 C5P01031 1676 aa26.42■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.41■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.41■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 HYPKQ9NX55 129 aa26.41■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 PDE1AP54750 535 aa26.41■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 KSR2Q6VAB6 950 aa26.4■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.4■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.4■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa26.4■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 TSHZ3Q63HK5 1081 aa26.4■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 SSH3Q8TE77 659 aa26.4■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.39■■□□□ 1.82
MESP1-201ENST00000300057 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.38■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 MRC1P22897 1456 aa26.38■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 SRGAP3O43295 1099 aa26.38■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 PDIA6Q15084 440 aa26.38■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.38■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.38■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26.38■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 ABCA3Q99758 1704 aa26.37■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP26.37■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 HSCBQ8IWL3 235 aa26.37■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 FSD2A1L4K1 749 aa26.36■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 MYL6BP14649 208 aa26.36■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 POLA2Q14181 598 aa26.36■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 SALL3Q9BXA9 1300 aa26.36■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 MX1P20591 662 aa26.35■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 CABP4P57796 275 aa26.35■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 CASC1Q6TDU7 716 aa26.35■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 KIF2CQ99661 725 aa26.35■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa26.35■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 ALDH1L1O75891 902 aa26.34■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 STRN4Q9NRL3 753 aa26.33■■□□□ 1.81
MESP1-201ENST00000300057 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.31■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 USP16Q9Y5T5 823 aa26.31■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.31■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.31■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.31■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.3■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 RAB11FIP3O75154 756 aa26.3■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 LINS1Q8NG48 757 aa26.3■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.3■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.28■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 RHPN1Q8TCX5 695 aa26.28■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 SNX21Q969T3 373 aa26.28■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 EVA1CP58658 441 aa26.28■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 COPS6Q7L5N1 327 aa26.28■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 IL2RBP14784 551 aa26.27■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 USP26Q9BXU7 913 aa26.27■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.27■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.27■■□□□ 1.8
MESP1-201ENST00000300057 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa26.26■■□□□ 1.79
MESP1-201ENST00000300057 GRM8O00222 908 aa26.26■■□□□ 1.79
MESP1-201ENST00000300057 STAP2Q9UGK3 403 aa26.26■■□□□ 1.79
MESP1-201ENST00000300057 RILPL2Q969X0 211 aa26.26■■□□□ 1.79
MESP1-201ENST00000300057 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.26■■□□□ 1.79
MESP1-201ENST00000300057 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
MESP1-201ENST00000300057 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
MESP1-201ENST00000300057 IGKV5-2P06315 115 aa26.25■■□□□ 1.79
MESP1-201ENST00000300057 MTX1Q13505 466 aa26.25■■□□□ 1.79
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