RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 UBAC1Q9BSL1 405 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 NACAP1Q9BZK3 213 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 SAMD9Q5K651 1589 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 KCNA6P17658 529 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 KLHL10Q6JEL2 608 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 AMOTQ4VCS5 1084 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 CHST3Q7LGC8 479 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 TMX3Q96JJ7 454 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 PLCH2O75038 1416 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ANKRD44Q8N8A2 993 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 PPP6R1Q9UPN7 881 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 CHD1O14646 1710 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 MAP3K19Q56UN5 1328 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 USP5P45974 858 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 DISP1Q96F81 1524 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ASXL2Q76L83 1435 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 A0A1W2PP64 1363 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 GJB2P29033 226 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 BRF1Q92994 677 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 NAPBQ9H115 298 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 MAP3K11Q16584 847 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 MICU3Q86XE3 530 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ZBTB9Q96C00 473 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 PTPRCP08575 1304 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 RALGAPBQ86X10 1494 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 KRT32Q14532 448 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 HYPKQ9NX55 129 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 CTNNA3Q9UI47 895 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 CFAP45Q9UL16 551 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 FAM135AQ9P2D6 1515 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 KCNA4P22459 653 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 CFAP100Q494V2 611 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 JMYQ8N9B5 988 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 FBXO3Q9UK99 471 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 UQCRHLA0A096LP55 91 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ZNF213O14771 459 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 STX6O43752 255 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 UQCRHP07919 91 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 CEP85Q6P2H3 762 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 NGLY1Q96IV0 654 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 C8orf76Q96K31 380 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ORAI2Q96SN7 254 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 TMX1Q9H3N1 280 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 LGR6Q9HBX8 967 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 PZPP20742 1482 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 KRT18P05783 430 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ZSCAN30Q86W11 494 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 A2MP01023 1474 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 EXOC5O00471 708 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 GCP02774 474 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 EPS15P42566 896 aa6.47□□□□□ -1.37
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