RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.37■■□□□ 1.17
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF827Q17R98 1081 aa22.36■■□□□ 1.17
SRSF1-201ENST00000258962 AKT1S1Q96B36 256 aa22.36■■□□□ 1.17
SRSF1-201ENST00000258962 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.36■■□□□ 1.17
SRSF1-201ENST00000258962 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SRSF1-201ENST00000258962 KRT24Q2M2I5 525 aa22.36■■□□□ 1.17
SRSF1-201ENST00000258962 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.36■■□□□ 1.17
SRSF1-201ENST00000258962 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SRSF1-201ENST00000258962 PANK1Q8TE04 598 aa22.35■■□□□ 1.17
SRSF1-201ENST00000258962 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.35■■□□□ 1.17
SRSF1-201ENST00000258962 RLBP1P12271 317 aa22.33■■□□□ 1.17
SRSF1-201ENST00000258962 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SRSF1-201ENST00000258962 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.33■■□□□ 1.17
SRSF1-201ENST00000258962 AK7Q96M32 723 aa22.32■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 KIF16BQ96L93 1317 aa22.32■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 PAPPAQ13219 1627 aa22.32■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 SLC39A6Q13433 755 aa22.31■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.31■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 ITPK1Q13572 414 aa22.31■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.31■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 MRC1P22897 1456 aa22.3■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 SPON1Q9HCB6 807 aa22.3■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 COG6Q9Y2V7 657 aa22.3■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 MSH5O43196 834 aa22.29■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 TRIM27P14373 513 aa22.29■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.29■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.28■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.28■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.28■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.28■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 BTBD11A6QL63 1104 aa22.27■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 ZBTB7AO95365 584 aa22.27■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.27■■□□□ 1.16
SRSF1-201ENST00000258962 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 C5P01031 1676 aa22.26■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF790Q6PG37 636 aa22.26■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 MTFR1LQ9H019 292 aa22.26■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 MS4A1P11836 297 aa22.25■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.25■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.24■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 GNPATO15228 680 aa22.24■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.23■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 C4BP0C0L5 1744 aa22.23■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 CACNA1FO60840 1977 aa22.23■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 PHF14O94880 888 aa22.22■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.22■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 SSFA2P28290 1259 aa22.21■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.21■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 CASZ1Q86V15 1759 aa22.21■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.21■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.2■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.2■■□□□ 1.15
SRSF1-201ENST00000258962 KCNQ3O43525 872 aa22.2■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 LRP5O75197 1615 aa22.19■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.19■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 RPS6KA4O75676 772 aa22.18■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 STARD3NLO95772 234 aa22.18■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.18■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 ABCC4O15439 1325 aa22.18■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.18■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.18■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.17■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 SMIM5Q71RC9 77 aa22.17■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.16■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 POLD1P28340 1107 aa22.16■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 AAMPQ13685 434 aa22.16■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.16■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.16■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 ADRA2BP18089 450 aa22.16■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 PTGER2P43116 358 aa22.16■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.15■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.15■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.14■■□□□ 1.14
SRSF1-201ENST00000258962 SLC4A2P04920 1241 aa22.14■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 RFC4P35249 363 aa22.14■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.14■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 HOXB7P09629 217 aa22.13■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
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