RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
LRP3-201ENST00000253193 KCNQ3O43525 872 aa22.24■■□□□ 1.15
LRP3-201ENST00000253193 CPA1P15085 419 aa22.24■■□□□ 1.15
LRP3-201ENST00000253193 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.24■■□□□ 1.15
LRP3-201ENST00000253193 RAB11FIP3O75154 756 aa22.23■■□□□ 1.15
LRP3-201ENST00000253193 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
LRP3-201ENST00000253193 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.23■■□□□ 1.15
LRP3-201ENST00000253193 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.23■■□□□ 1.15
LRP3-201ENST00000253193 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
LRP3-201ENST00000253193 TBX22Q9Y458 520 aa22.23■■□□□ 1.15
LRP3-201ENST00000253193 TSPY26PQ9H489 355 aa22.23■■□□□ 1.15
LRP3-201ENST00000253193 PHF14O94880 888 aa22.22■■□□□ 1.15
LRP3-201ENST00000253193 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
LRP3-201ENST00000253193 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.22■■□□□ 1.15
LRP3-201ENST00000253193 RGS12O14924 1447 aa22.22■■□□□ 1.15
LRP3-201ENST00000253193 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
LRP3-201ENST00000253193 ZNF445P59923 1031 aa22.21■■□□□ 1.15
LRP3-201ENST00000253193 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
LRP3-201ENST00000253193 AACSQ86V21 672 aa22.21■■□□□ 1.15
LRP3-201ENST00000253193 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
LRP3-201ENST00000253193 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
LRP3-201ENST00000253193 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.2■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.2■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 NBPF4Q96M43 638 aa22.2■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 ANAPC15P60006 121 aa22.2■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 FGD1P98174 961 aa22.2■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.2■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.2■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.2■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.19■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.19■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.19■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 MYL6BP14649 208 aa22.18■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.18■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 USP48Q86UV5 1035 aa22.18■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.17■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.17■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 SSH3Q8TE77 659 aa22.17■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 BRD1O95696 1058 aa22.16■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.16■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.16■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.16■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.16■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.16■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 AK2P54819 239 aa22.16■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.16■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 OFD1O75665 1012 aa22.15■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 TPM2P07951 284 aa22.15■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 FSD1Q9BTV5 496 aa22.15■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.15■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.15■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 IL25Q9H293 177 aa22.15■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 USP31Q70CQ4 1352 aa22.15■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.14■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.14■■□□□ 1.14
LRP3-201ENST00000253193 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.14■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.14■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 FERMT3Q86UX7 667 aa22.14■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.14■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 STAP2Q9UGK3 403 aa22.14■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 AGLP35573 1532 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 SGSM2O43147 1006 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 HSPA4P34932 840 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 TECPR2O15040 1411 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 STX6O43752 255 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 STK3Q13188 491 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 RASEFQ8IZ41 740 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 IP6K1Q92551 441 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 NECAB1Q8N987 351 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 USP25Q9UHP3 1055 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 SLC39A6Q13433 755 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 PTPRUQ92729 1446 aa22.09■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 BEND3Q5T5X7 828 aa22.09■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.09■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 GJB2P29033 226 aa22.09■■□□□ 1.13
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