RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253008.2

PRDM12-201, Transcript of PR/SET domain 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM12, Length 2,476 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12-201ENST00000253008 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PRDM12-201ENST00000253008 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PRDM12-201ENST00000253008 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.27■■□□□ 1.16
PRDM12-201ENST00000253008 RBSNQ9H1K0 784 aa22.27■■□□□ 1.16
PRDM12-201ENST00000253008 DTNBO60941 627 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.25■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.25■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 ZNF445P59923 1031 aa22.25■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 IP6K1Q92551 441 aa22.25■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 POLA2Q14181 598 aa22.24■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.24■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.24■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.24■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 BEND3Q5T5X7 828 aa22.24■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 CUL4AQ13619 759 aa22.23■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.23■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.23■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 MCCP23508 829 aa22.22■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.22■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 PROSER3Q2NL68 480 aa22.22■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.22■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 BRD1O95696 1058 aa22.21■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 SYCE3A1L190 88 aa22.21■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.21■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.21■■□□□ 1.15
PRDM12-201ENST00000253008 BTBD11A6QL63 1104 aa22.2■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 PSME1Q06323 249 aa22.2■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.2■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 RASEFQ8IZ41 740 aa22.2■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 CPA1P15085 419 aa22.19■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 SPG7Q9UQ90 795 aa22.19■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 ADCY9O60503 1353 aa22.19■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 ANAPC15P60006 121 aa22.19■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.18■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 HSPA4P34932 840 aa22.18■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 TEFQ10587 303 aa22.18■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.18■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 LTN1O94822 1766 aa22.17■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 RAB11FIP3O75154 756 aa22.17■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.17■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.17■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 SGSM2O43147 1006 aa22.16■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 MCM2P49736 904 aa22.16■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 ORAI2Q96SN7 254 aa22.16■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.16■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.16■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 AOX1Q06278 1338 aa22.15■■□□□ 1.14
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PRDM12-201ENST00000253008 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 PXDNQ92626 1479 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 NFAT5O94916 1531 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 RNF214Q8ND24 703 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 CACNA1FO60840 1977 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM12-201ENST00000253008 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 RAD50Q92878 1312 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 AK2P54819 239 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 PTH1RQ03431 593 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 IL17RAQ96F46 866 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 GCP02774 474 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 CNTROBQ8N137 903 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 LARGE1O95461 756 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 RUFY3Q7L099 469 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 TTC14Q96N46 770 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 USP48Q86UV5 1035 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 USP54Q70EL1 1684 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 HOXB7P09629 217 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM12-201ENST00000253008 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM12-201ENST00000253008 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM12-201ENST00000253008 KAZALD1Q96I82 304 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM12-201ENST00000253008 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PRDM12-201ENST00000253008 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PRDM12-201ENST00000253008 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.07■■□□□ 1.12
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