RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 C14orf37Q86TY3 774 aa27.62■■■□□ 2.01
ANKRD54-201ENST00000215941 MCM10Q7L590 875 aa27.62■■■□□ 2.01
ANKRD54-201ENST00000215941 PLEKHG5O94827 1062 aa27.61■■■□□ 2.01
ANKRD54-201ENST00000215941 RBM10P98175 930 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
ANKRD54-201ENST00000215941 EYA1Q99502 592 aa27.61■■■□□ 2.01
ANKRD54-201ENST00000215941 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.61■■■□□ 2.01
ANKRD54-201ENST00000215941 KDRP35968 1356 aa27.6■■■□□ 2.01
ANKRD54-201ENST00000215941 PTMAP06454 111 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
ANKRD54-201ENST00000215941 HOXC9P31274 260 aa27.6■■■□□ 2.01
ANKRD54-201ENST00000215941 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.6■■■□□ 2.01
ANKRD54-201ENST00000215941 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
ANKRD54-201ENST00000215941 ATP8B2P98198 1209 aa27.59■■■□□ 2.01
ANKRD54-201ENST00000215941 PRIMPOLQ96LW4 560 aa27.58■■■□□ 2.01
ANKRD54-201ENST00000215941 ANO2Q9NQ90 1003 aa27.58■■■□□ 2.01
ANKRD54-201ENST00000215941 RNF214Q8ND24 703 aa27.58■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 PALD1Q9ULE6 856 aa27.58■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.57■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 PSME1Q06323 249 aa27.57■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC183Q5T5S1 534 aa27.56■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 CHAMP1Q96JM3 812 aa27.56■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP27.56■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 NWD1Q149M9 1564 aa27.55■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC4A10Q6U841 1118 aa27.55■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 STK31Q9BXU1 1019 aa27.55■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa27.55■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 MYRIPQ8NFW9 859 aa27.55■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 HSPA4P34932 840 aa27.54■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 PIBF1Q8WXW3 757 aa27.54■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.54■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 FOXO3O43524 673 aa27.53■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 USP48Q86UV5 1035 aa27.53■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 G2E3Q7L622 706 aa27.53■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 LRRC37A3O60309 1634 aa27.53■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa27.52■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
ANKRD54-201ENST00000215941 RILPL2Q969X0 211 aa27.51■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 F6X3S4 739 aa27.5■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 LTN1O94822 1766 aa27.5■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP27.5■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa27.5■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC30Q5VVM6 783 aa27.49■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 UBE2HP62256 183 aa27.49■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 TCHHQ07283 1943 aa27.48■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 RAB11FIP3O75154 756 aa27.48■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 ORAI2Q96SN7 254 aa27.48■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 NFAT5O94916 1531 aa27.48■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 FLIIQ13045 1269 aa27.47■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 RAD50Q92878 1312 aa27.47■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 SPTLC3Q9NUV7 552 aa27.46■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.46■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 TPM3P06753 285 aa27.46■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 BABAM1Q9NWV8 329 aa27.46■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP27.45■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 TSHZ3Q63HK5 1081 aa27.45■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.45■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 IP6K1Q92551 441 aa27.45■■□□□ 1.99
ANKRD54-201ENST00000215941 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 SSH3Q8TE77 659 aa27.43■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 TTC14Q96N46 770 aa27.43■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.43■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.42■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 SGSM2O43147 1006 aa27.42■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 ADCY5O95622 1261 aa27.42■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.41■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa27.41■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 STX6O43752 255 aa27.41■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 GDPD2Q9HCC8 539 aa27.41■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 USP25Q9UHP3 1055 aa27.41■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.4■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 KDM4AO75164 1064 aa27.4■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.4■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.39■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 PRDM4Q9UKN5 801 aa27.39■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
ANKRD54-201ENST00000215941 F13A1P00488 732 aa27.38■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.38■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 SNX14Q9Y5W7 946 aa27.38■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 FUCA2Q9BTY2 467 aa27.38■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 MAP3K5Q99683 1374 aa27.37■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 POLA2Q14181 598 aa27.37■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 CNTROBQ8N137 903 aa27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms