RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 A1BGP04217 495 aa23.82■■□□□ 1.4
PRRT1-201ENST00000211413 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
PRRT1-201ENST00000211413 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
PRRT1-201ENST00000211413 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.8■■□□□ 1.4
PRRT1-201ENST00000211413 MYL6BP14649 208 aa23.8■■□□□ 1.4
PRRT1-201ENST00000211413 SIK1P57059 783 aa23.8■■□□□ 1.4
PRRT1-201ENST00000211413 ITPK1Q13572 414 aa23.8■■□□□ 1.4
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.8■■□□□ 1.4
PRRT1-201ENST00000211413 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.8■■□□□ 1.4
PRRT1-201ENST00000211413 ATP6V1AP38606 617 aa23.8■■□□□ 1.4
PRRT1-201ENST00000211413 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.8■■□□□ 1.4
PRRT1-201ENST00000211413 PDIA6Q15084 440 aa23.78■■□□□ 1.4
PRRT1-201ENST00000211413 HOXB7P09629 217 aa23.77■■□□□ 1.4
PRRT1-201ENST00000211413 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
PRRT1-201ENST00000211413 STK31Q9BXU1 1019 aa23.77■■□□□ 1.4
PRRT1-201ENST00000211413 NBPF26B4DH59 902 aa23.76■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 NBPF14Q5TI25 921 aa23.76■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 SMIM5Q71RC9 77 aa23.76■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 NBPF15Q8N660 670 aa23.76■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 TJP1Q07157 1748 aa23.76■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 PANK1Q8TE04 598 aa23.76■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 RLBP1P12271 317 aa23.75■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF428Q96B54 188 aa23.75■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 APBA3O96018 575 aa23.74■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 F6X3S4 739 aa23.73■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 TRIM27P14373 513 aa23.73■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.73■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.73■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.73■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.73■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 FLIIQ13045 1269 aa23.72■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.71■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 PROM2Q8N271 834 aa23.71■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.71■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.71■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.71■■□□□ 1.39
PRRT1-201ENST00000211413 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.7■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 LY75O60449 1722 aa23.69■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 STARD3NLO95772 234 aa23.69■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 COPS6Q7L5N1 327 aa23.69■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.69■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 CRBNQ96SW2 442 aa23.69■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 KIF16BQ96L93 1317 aa23.68■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 COG6Q9Y2V7 657 aa23.68■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.67■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 CACNA1FO60840 1977 aa23.67■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.67■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 ARXQ96QS3 562 aa23.67■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.66■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.65■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.65■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 HYPKQ9NX55 129 aa23.65■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.65■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 TXNRD1Q16881 649 aa23.65■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.65■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.65■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
PRRT1-201ENST00000211413 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
PRRT1-201ENST00000211413 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.64■■□□□ 1.37
PRRT1-201ENST00000211413 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.64■■□□□ 1.37
PRRT1-201ENST00000211413 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.64■■□□□ 1.37
PRRT1-201ENST00000211413 MSH5O43196 834 aa23.63■■□□□ 1.37
PRRT1-201ENST00000211413 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PRRT1-201ENST00000211413 ADCY9O60503 1353 aa23.61■■□□□ 1.37
PRRT1-201ENST00000211413 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.61■■□□□ 1.37
PRRT1-201ENST00000211413 PTPRCP08575 1304 aa23.61■■□□□ 1.37
PRRT1-201ENST00000211413 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.61■■□□□ 1.37
PRRT1-201ENST00000211413 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.61■■□□□ 1.37
PRRT1-201ENST00000211413 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.61■■□□□ 1.37
PRRT1-201ENST00000211413 PLSCR1O15162 318 aa23.6■■□□□ 1.37
PRRT1-201ENST00000211413 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.59■■□□□ 1.37
PRRT1-201ENST00000211413 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PRRT1-201ENST00000211413 PDE3AQ14432 1141 aa23.59■■□□□ 1.37
PRRT1-201ENST00000211413 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.59■■□□□ 1.37
PRRT1-201ENST00000211413 ABCC4O15439 1325 aa23.58■■□□□ 1.37
PRRT1-201ENST00000211413 GNPATO15228 680 aa23.58■■□□□ 1.37
PRRT1-201ENST00000211413 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.58■■□□□ 1.37
PRRT1-201ENST00000211413 ERBB4Q15303 1308 aa23.58■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.57■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.57■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
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