RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000188376.9

SLC25A3-201, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-201ENST00000188376 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.14■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 PAPPAQ13219 1627 aa24.14■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 CERKQ8TCT0 537 aa24.14■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.14■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 EXOC5O00471 708 aa24.14■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.14■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 JCADQ9P266 1359 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 NUCB1Q02818 461 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 SLIT2O94813 1529 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 GNAI2P04899 355 aa24.12■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 GNAI3P08754 354 aa24.12■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 MYL6BP14649 208 aa24.12■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.12■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 FAM161AQ3B820 660 aa24.12■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.12■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.11■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 BEND3Q5T5X7 828 aa24.11■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 KSR2Q6VAB6 950 aa24.11■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 LNPKQ9C0E8 428 aa24.11■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 USP44Q9H0E7 712 aa24.11■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 C8orf34Q49A92 452 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 ANKRD45Q5TZF3 282 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 TNS2Q63HR2 1409 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 ITGB4P16144 1822 aa24.09■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.09■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.09■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.09■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 DCTPP1Q9H773 170 aa24.08■■□□□ 1.45
SLC25A3-201ENST00000188376 C8orf37Q96NL8 207 aa24.08■■□□□ 1.44
SLC25A3-201ENST00000188376 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SLC25A3-201ENST00000188376 PIGBQ92521 554 aa24.07■■□□□ 1.44
SLC25A3-201ENST00000188376 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A3-201ENST00000188376 NGLY1Q96IV0 654 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A3-201ENST00000188376 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SLC25A3-201ENST00000188376 DDB1Q16531 1140 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A3-201ENST00000188376 COPS6Q7L5N1 327 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A3-201ENST00000188376 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A3-201ENST00000188376 HMMRO75330 724 aa24.05■■□□□ 1.44
SLC25A3-201ENST00000188376 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.05■■□□□ 1.44
SLC25A3-201ENST00000188376 LRP6O75581 1613 aa24.05■■□□□ 1.44
SLC25A3-201ENST00000188376 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.04■■□□□ 1.44
SLC25A3-201ENST00000188376 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.04■■□□□ 1.44
SLC25A3-201ENST00000188376 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SLC25A3-201ENST00000188376 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SLC25A3-201ENST00000188376 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SLC25A3-201ENST00000188376 ALDH1L1O75891 902 aa24.02■■□□□ 1.44
SLC25A3-201ENST00000188376 BARGINQ6ZT62 677 aa24.02■■□□□ 1.44
SLC25A3-201ENST00000188376 ATG3Q9NT62 314 aa24.02■■□□□ 1.44
SLC25A3-201ENST00000188376 BCL9O00512 1426 aa24.01■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.01■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.01■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 ATP8B2P98198 1209 aa24.01■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.01■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 NBPF26B4DH59 902 aa24■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 NBPF14Q5TI25 921 aa24■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 NBPF15Q8N660 670 aa24■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 LINS1Q8NG48 757 aa24■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 ERBB4Q15303 1308 aa24■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 APBB1O00213 710 aa23.99■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 A1BGP04217 495 aa23.99■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 BCL11AQ9H165 835 aa23.99■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 HSPA1LP34931 641 aa23.97■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.97■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.96■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 IGKV5-2P06315 115 aa23.96■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 VPS72Q15906 364 aa23.96■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 MYD88Q99836 296 aa23.96■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.96■■□□□ 1.43
SLC25A3-201ENST00000188376 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.95■■□□□ 1.42
SLC25A3-201ENST00000188376 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
SLC25A3-201ENST00000188376 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.94■■□□□ 1.42
SLC25A3-201ENST00000188376 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.94■■□□□ 1.42
SLC25A3-201ENST00000188376 A0A0G2JS52 829 aa23.94■■□□□ 1.42
SLC25A3-201ENST00000188376 GRM8O00222 908 aa23.94■■□□□ 1.42
SLC25A3-201ENST00000188376 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
SLC25A3-201ENST00000188376 USP21Q9UK80 565 aa23.94■■□□□ 1.42
SLC25A3-201ENST00000188376 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.93■■□□□ 1.42
SLC25A3-201ENST00000188376 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.93■■□□□ 1.42
SLC25A3-201ENST00000188376 SSH3Q8TE77 659 aa23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms