RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp8b2P98199 1209 aa15.16■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa15.16■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ddrgk1Q80WW9 315 aa15.16■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rai14Q9EP71 979 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ArsiQ32KI9 573 aa15.16■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa15.15■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mctp2Q5RJH2 878 aa15.15■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc43Q9CR29 222 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ipo7Q9EPL8 1038 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zscan20B2KFW1 1030 aa15.15■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam213aQ9CYH2 218 aa15.15■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Calcoco2A2A6M5 331 aa15.14■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MycnP03966 462 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdkl5Q3UTQ8 938 aa15.14■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Phkg2Q9DB30 406 aa15.14■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NsmfQ99NF2 532 aa15.14■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Odf2A3KGV1 830 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pm20d1Q8C165 503 aa15.14■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nup133Q8R0G9 1155 aa15.14■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa15.13■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trim30aP15533 496 aa15.13■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rufy2Q8R4C2 606 aa15.13■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PdcQ9QW08 244 aa15.13■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nos1Q9Z0J4 1429 aa15.13■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krt25Q8VCW2 446 aa15.13■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pet2A2AHY8 747 aa15.13■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Izumo3A6PWV3 263 aa15.13■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm7347D3YYI9 267 aa15.13■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Speer4aF8VPX6 267 aa15.13■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cep55Q8BT07 462 aa15.13■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa15.12■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SympkQ80X82 1284 aa15.12■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spg7Q3ULF4 781 aa15.12■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Jarid2Q62315 1234 aa15.12■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem143Q8VD26 458 aa15.12■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdc45Q9Z1X9 566 aa15.12■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prr29B1ARI9 187 aa15.11■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hmgn5Q9JL35 406 aa15.11■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plch2A2AP18 1501 aa15.11■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krt85Q9Z2T6 507 aa15.11■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ush1cQ9ES64 910 aa15.11■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kiaa0754Q69ZZ9 979 aa15.11■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Miga2Q8BK03 593 aa15.11■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tshz3Q8CGV9 1081 aa15.11■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Polr3dQ91WD1 398 aa15.11■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa15.11■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc35g1Q8BY79 368 aa15.1■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tarbp1E9Q368 1579 aa15.1■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp2b3Q0VF55 1220 aa15.1■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trim28Q62318 834 aa15.1■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem266Q8BZB3 538 aa15.1■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mcmdc2E9Q956 681 aa15.1■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cpa2Q504N0 417 aa15.1■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf18Q810A1 556 aa15.1■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp4r3bQ922R5 820 aa15.1■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rbbp8nlA2ABX0 614 aa15.09■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aifm3Q3TY86 605 aa15.09■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa15.09■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kdm4aQ8BW72 1064 aa15.09■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Jdp2P97875 163 aa15.09■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa15.08■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 LifrP42703 1092 aa15.08■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Galntl5Q9D4M9 431 aa15.08■□□□□ 0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mroh2aD3Z750 1679 aa15.08■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ncoa4Q5U4H9 625 aa15.08■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psrc1Q9D0P7 329 aa15.08■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pdzd9Q9D9M4 266 aa15.08■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ces1hD3Z298 562 aa15.08■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nkx1-2P42580 305 aa15.08■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrc43Q3V0L5 667 aa15.08■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hand2Q61039 217 aa15.08■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ssh1Q76I79 1042 aa15.08■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ier5O89113 308 aa15.07■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aldh1l2Q8K009 923 aa15.07■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 EvcP57680 1005 aa15.07■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plekhg1F6S200 1446 aa15.07■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam160b2Q80YR2 744 aa15.07■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc178Q8CDV0 866 aa15.07■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 St5Q924W7 1134 aa15.07■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf287Q9EQB9 759 aa15.07■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfyve16Q80U44 1528 aa15.06■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp26c1B2RXA7 518 aa15.06■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf41Q8BH75 317 aa15.06■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wasf1Q8R5H6 559 aa15.06■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Asic4Q7TNS7 539 aa15.06■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa15.06■□□□□ 0
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AnkarA2RT91 1465 aa15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52.9 ms