RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641480.1

CASC19-232, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

BASIC

Gene CASC19, Length 1,244 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-232ENST00000641480 SOX9P48436 509 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 CTSCP53634 463 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 NR1H2P55055 460 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 DMPKQ09013 629 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 NAE1Q13564 534 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 RUNX3Q13761 415 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 APOFQ13790 326 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 VEZF1Q14119 521 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 PTGR1Q14914 329 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 CYP2A13Q16696 494 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 NHSL2Q5HYW2 709 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 HMBOX1Q6NT76 420 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 SUSD1Q6UWL2 747 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 LCTLQ6UWM7 567 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 C12orf40Q86WS4 652 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 SYT12Q8IV01 421 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 VRK3Q8IV63 474 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 KRT78Q8N1N4 520 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 ASB12Q8WXK4 309 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 SORCS1Q8WY21 1168 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 TFAP2CQ92754 450 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 FAM131CQ96AQ9 280 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 BIRC7Q96CA5 298 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 PPM1MQ96MI6 270 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 ZNF583Q96ND8 569 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 TMEM74Q96NL1 305 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 FAM129BQ96TA1 746 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 ADI1Q9BV57 179 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 NT5DC2Q9H857 520 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 PELI2Q9HAT8 420 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 HPS4Q9NQG7 708 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 USE1Q9NZ43 259 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 AHSPQ9NZD4 102 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 VAPAQ9P0L0 249 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 FADS3Q9Y5Q0 445 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 ITPR1Q14643 2758 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 COL4A2P08572 1712 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 RNF223E7ERA6 249 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 CXCR6O00574 342 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 KMOO15229 486 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 CLOCKO15516 846 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 AHCYL1O43865 530 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 DFNA5O60443 496 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 TBX19O60806 448 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 MTX2O75431 263 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 KAT7O95251 611 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 H6PDO95479 791 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 SLC16A8O95907 504 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 FESP07332 822 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 GPX2P18283 190 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 ITPKAP23677 461 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 ACADLP28330 430 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 HOXD12P35452 270 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 CAPGP40121 348 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 OPRD1P41143 372 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 P2RY2P41231 377 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 DGKQP52824 942 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 ARFIP1P53367 373 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 OR4D2P58180 307 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 TBPL1P62380 186 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 RBBP4Q09028 425 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 ZNF763Q0D2J5 394 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 MERTKQ12866 999 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 IL18R1Q13478 541 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 DOC2AQ14183 400 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 TEAD4Q15561 434 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 SGO1Q5FBB7 561 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 LRRC73Q5JTD7 316 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 CPZQ66K79 652 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CASC19-232ENST00000641480 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms