RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640634.1

SCARB2-222, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-222	ENST00000640634	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	STX16	O14662	325 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	FFAR3	O14843	346 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	GPR42	O15529	346 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	SH3BGRL	O75368	114 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	WFS1	O76024	890 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	DLGAP3	O95886	979 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	PDGFA	P04085	211 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	SERPIND1	P05546	499 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	MYL2	P10916	166 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	CPA3	P15088	417 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	PRKAA2	P54646	552 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	HERVK_113	P63132	956 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	IRF8	Q02556	426 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	TRAF3	Q13114	568 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	CES4A	Q5XG92	561 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ATG9B	Q674R7	924 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	HDX	Q7Z353	690 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	TLCD1	Q96CP7	247 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	PELI2	Q9HAT8	420 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	FANCE	Q9HB96	536 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	COPG2	Q9UBF2	871 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF225	Q9UK10	706 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	MGA	Q8IWI9	3026 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	TRBC2	A0A5B9	178 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	NDUFS4	O43181	175 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	TNFRSF21	O75509	655 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	SUPT7L	O94864	414 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	TAC1	P20366	129 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ALDH3A1	P30838	453 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	HNF4A	P41235	474 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ETV4	P43268	484 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	SCTR	P47872	440 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	NAGLU	P54802	743 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	CLN3	Q13286	438 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	FXN	Q16595	210 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC153	Q494R4	210 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	LSMEM2	Q8N112	164 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	KLHL31	Q9H511	634 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	OXSM	Q9NWU1	459 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ACACA	Q13085	2346 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	WDR91	A4D1P6	747 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	RAD1	O60671	282 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	PGR	P06401	933 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	F8A1	P23610	371 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ARRB2	P32121	409 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	RORA	P35398	523 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	HYAL2	Q12891	473 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	KRT72	Q14CN4	511 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	RBBP7	Q16576	425 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	SYVN1	Q86TM6	617 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	ASPG	Q86U10	573 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCARB2-222	ENST00000640634	DTX1	Q86Y01	620 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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