RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	PRR35	P0CG20	571 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MTHFD2	P13995	350 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	HTR2B	P41595	481 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CTSK	P43235	329 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	GNPDA1	P46926	289 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SLC6A11	P48066	632 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MASP1	P48740	699 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CLCN7	P51798	805 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	DGCR6	Q14129	220 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PDGFRL	Q15198	375 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	GAB4	Q2WGN9	574 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	FBXO43	Q4G163	708 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	UNC50	Q53HI1	259 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NXPE1	Q8N323	547 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	LINGO1	Q96FE5	620 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	BOC	Q9BWV1	1114 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MTG2	Q9H4K7	406 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	DEC1	Q9P2X7	70 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	POLG2	Q9UHN1	485 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RNF112	Q9ULX5	631 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	BTRC	Q9Y297	605 aa		14.79	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PQ72	361 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	IQCF5	A8MTL0	148 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CDC7	O00311	574 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	BET1	O15155	118 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NAGA	P17050	411 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	FCAR	P24071	287 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	VIPR1	P32241	457 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MAP2K4	P45985	399 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	OR4D2	P58180	307 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ARHGEF7	Q14155	803 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SPESP1	Q6UW49	350 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	KRT87P	A6NCN2	255 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	BTN3A1	O00481	513 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	LINC01565	O15544	149 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	XPNPEP2	O43895	674 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ECI2	O75521	394 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SEMA3D	O95025	777 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CTSL	P07711	333 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TIMP2	P16035	220 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF30	P17039	623 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MSH3	P20585	1137 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	IL32	P24001	234 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SPINT3	P49223	89 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CTAG1A	P78358	180 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PFKFB4	Q16877	469 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CADM2	Q8N3J6	435 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NXPE3	Q969Y0	559 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RNF6	Q9Y252	685 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659		V9GYQ6	96 aa		14.78	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ASPDH	A6ND91	283 aa		14.77	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PRRT4	C9JH25	899 aa		14.77	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ARNTL	O00327	626 aa		14.77	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NOBOX	O60393	691 aa		14.77	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SCEL	O95171	688 aa		14.77	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	IL12RB1	P42701	662 aa		14.77	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	GPLD1	P80108	840 aa		14.77	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	HYAL1	Q12794	435 aa		14.77	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RAPSN	Q13702	412 aa		14.77	□□□□□ -0.04

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