RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622875.4

EBF1-211, Transcript of early B cell factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene EBF1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1-211ENST00000622875 ORC5O43913 435 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 UGDHO60701 494 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 SOAT2O75908 522 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 PSAPP07602 524 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 STSP08842 583 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 THRAP10827 490 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 ODC1P11926 461 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 CKMT2P17540 419 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 IL1R2P27930 398 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 ARSFP54793 590 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 ITGA1P56199 1179 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 SCN1BQ07699 218 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 SYT16Q17RD7 645 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 RALGPS1Q5JS13 557 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 AGAP6Q5VW22 663 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 PADI6Q6TGC4 694 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 MFSD2AQ8NA29 543 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 TPCN2Q8NHX9 752 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 FAM45AQ8TCE6 357 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 SNAPC3Q92966 411 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 GAL3ST3Q96A11 431 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 AGAP4Q96P64 663 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 S100A13Q99584 98 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 FAM83CQ9BQN1 747 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 PINK1Q9BXM7 581 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 IL21RQ9HBE5 538 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 ZSWIM5Q9P217 1185 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 MTORP42345 2549 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 A0A1W2PPL8 197 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 ZNF233A6NK53 670 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 KCNK3O14649 394 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 AP2A2O94973 939 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 CYP11A1P05108 521 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 RARGP13631 454 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 SAT1P21673 171 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 GNG10P50151 68 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 CCR4P51679 360 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 BMXP51813 675 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 DEFA5Q01523 94 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 TLE4Q04727 773 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 PRAMEF20Q5VT98 475 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 PDSS2Q86YH6 399 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 SLC30A5Q8TAD4 765 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 C22orf15Q8WYQ4 148 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 FBXO32Q969P5 355 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 PPP1R36Q96LQ0 422 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 ZNF559Q9BR84 538 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 NT5C1AQ9BXI3 368 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 OSGEPQ9NPF4 335 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 NANSQ9NR45 359 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 SLC35D1Q9NTN3 355 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 SPHK1Q9NYA1 384 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 C3orf18Q9UK00 162 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 ESYT3A0FGR9 886 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 TRIM49BA6NDI0 452 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 CDRT15L2A8MXV6 281 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 TRIM49D1C9J1S8 452 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 LGI1O95970 557 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 STAG3L2P0CL84 134 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 MYBP10242 640 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 DDCP20711 480 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 L1CAMP32004 1257 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 PTGER4P35408 488 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 ZNF543Q08ER8 600 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 ZNF529Q6P280 563 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 ANKRD46Q86W74 232 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 CADM2Q8N3J6 435 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 PRR18Q8N4B5 295 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 RORBQ92753 470 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 CREB3L1Q96BA8 519 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 MENTQ9BUN1 341 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 COMMD4Q9H0A8 199 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 ATXN3LQ9H3M9 355 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 DTLQ9NZJ0 730 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 ACSL6Q9UKU0 697 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 CAMK2AQ9UQM7 478 aa5.45□□□□□ -1.54
EBF1-211ENST00000622875 A1L4Q6 167 aa5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.5 ms