RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594216.1

RAB11B-202, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RAB11B, Length 894 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-202ENST00000594216 SCYL1Q96KG9 808 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 EHD1Q9H4M9 534 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 ZNF358Q9NW07 568 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 FETUBQ9UGM5 382 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 C3orf18Q9UK00 162 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 SLC22A7Q9Y694 548 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 SPTBP11277 2137 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 URADA6NGE7 173 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 AGPSO00116 658 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 RDH16O75452 317 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 KLHL18O94889 574 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 IGHEP01854 428 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 EPB42P16452 691 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 HNF4AP41235 474 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 IRF8Q02556 426 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 DOC2AQ14183 400 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 SETDB1Q15047 1291 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 TECRLQ5HYJ1 363 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 PDSS2Q86YH6 399 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 ZNF843Q8N446 348 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 CLEC1AQ8NC01 280 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 CCT6BQ92526 530 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 TGIF2Q9GZN2 237 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 HCN3Q9P1Z3 774 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 XPR1Q9UBH6 696 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 KALRNO60229 2985 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 ZNF860A6NHJ4 632 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 ANKDD1BA6NHY2 528 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 A6NL46 340 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 IDSB3KWA1 339 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 KLK8O60259 260 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 SHBGP04278 402 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 HEXBP07686 556 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 SERPINA6P08185 405 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 ALOX12P18054 663 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 EPORP19235 508 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 GSTM2P28161 218 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 EMP2P54851 167 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 VSNL1P62760 191 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 SKP1P63208 163 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 CHIT1Q13231 466 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 LAPTM5Q13571 262 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 DEFB134Q4QY38 66 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 DCAF10Q5QP82 559 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 TIFABQ6ZNK6 161 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 LAPTM4BQ86VI4 370 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 CNPY4Q8N129 248 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 TEX9Q8N6V9 391 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 OR51Q1Q8NH59 317 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 VPS50Q96JG6 964 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 SLC6A16Q9GZN6 736 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 NT5DC2Q9H857 520 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 TBK1Q9UHD2 729 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RAB11B-202ENST00000594216 SOCS6O14544 535 aa14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 PRAMEF4O60810 478 aa14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 SMIM24O75264 130 aa14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 XCR1P46094 333 aa14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 RAB8AP61006 207 aa14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 TBCCQ15814 346 aa14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 MFSD4BQ5TF39 518 aa14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 CREB3L4Q8TEY5 395 aa14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 PHF21BQ96EK2 531 aa14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 WDR34Q96EX3 536 aa14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 SLC25A23Q9BV35 468 aa14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 COPG2Q9UBF2 871 aa14.58□□□□□ -0.08
RAB11B-202ENST00000594216 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms