RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 TRPC4Q9UBN4 977 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 CTSFQ9UBX1 484 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 FETUBQ9UGM5 382 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 DCDC2Q9UHG0 476 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 POLHQ9Y253 713 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 PADI2Q9Y2J8 665 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 USP24Q9UPU5 2620 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 PCSK5Q92824 1860 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 TPRP12270 2363 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A0G2JN53 185 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC189A1A4V9 331 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF860A6NHJ4 632 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 A6NL46 340 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 TK2O00142 265 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 MASP2O00187 686 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 PEX12O00623 359 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 PRB1P04280 392 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 ITGB2P05107 769 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 HEXBP07686 556 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 UMODP07911 640 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 SBK3P0C264 359 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC35G6P0C7Q6 338 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM87AP0C7U9 286 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 PCNAP12004 261 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 CD22P20273 847 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 TAC1P20366 129 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 EMP2P54851 167 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 OLR1P78380 273 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 KLC1Q07866 573 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 HYAL2Q12891 473 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 CHAF1BQ13112 559 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 LAPTM5Q13571 262 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 PWP1Q13610 501 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP1A4Q13733 1029 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 27.4
EFTUD2-211ENST00000588374 DEFB134Q4QY38 66 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 MFSD4BQ5TF39 518 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 EMBQ6PCB8 327 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 PDSS2Q86YH6 399 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB43Q86YS6 212 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 AMER3Q8N944 861 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 OR51Q1Q8NH59 317 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 NT5CQ8TCD5 201 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 CREB3L4Q8TEY5 395 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 MZB1Q8WU39 189 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 THAP4Q8WY91 577 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 CAVIN3Q969G5 261 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 FKBP10Q96AY3 582 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 MVB12AQ96EY5 273 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 EFCAB11Q9BUY7 163 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM117AQ9C073 453 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 RHBGQ9H310 441 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 IPPKQ9H8X2 491 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 XPR1Q9UBH6 696 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 TMCO1Q9UM00 188 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 PLAAQ9Y263 795 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC22A7Q9Y694 548 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 NUP210LQ5VU65 1888 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 ZZEF1O43149 2961 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 SEC16AO15027 2179 aa6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 LRIT2A6NDA9 550 aa6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 OR2W5A6NFC9 320 aa6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 URADA6NGE7 173 aa6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 VSTM2BA6NLU5 285 aa6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 H0YIG0 161 aa6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 E2F3O00716 465 aa6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-211ENST00000588374 COPEO14579 308 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms