RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558131.1

RPL28-205, Transcript of ribosomal protein L28, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RPL28, Length 444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28-205ENST00000558131 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 CRYABP02511 175 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 UQCRHP07919 91 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 SLC35G6P0C7Q6 338 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 CCND1P24385 295 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 RGS4P49798 205 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 HYAL2Q12891 473 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 USP10Q14694 798 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 ABRAXAS2Q15018 415 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 PPP1R3AQ16821 1122 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 SFT2D3Q587I9 215 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 SPANXN3Q5MJ09 141 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 CATSPEREQ5SY80 951 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 UGT3A1Q6NUS8 523 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 SBSNQ6UWP8 590 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 KIAA0408Q6ZU52 694 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 MYO1HQ8N1T3 1032 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 SLC35F6Q8N357 371 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 M1APQ8TC57 530 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 SLCO2A1Q92959 643 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 OR1F2PQ96R84 312 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 FAM129AQ9BZQ8 928 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 AICDAQ9GZX7 198 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 ANKRD10Q9NXR5 420 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 CREBBPQ92793 2442 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 ENO4A6NNW6 628 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 MAGEB17A8MXT2 336 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 NDUFS4O43181 175 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 NRDCO43847 1150 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 NEURL1O76050 574 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 CD96P40200 585 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 SLC26A5P58743 744 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 OLR1P78380 273 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 ADORA2A-AS1P86434 159 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 ART3Q13508 389 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 EXT1Q16394 746 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 DUPD1Q68J44 220 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 TMEM207Q6UWW9 146 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 STRA8Q7Z7C7 330 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 ZNF227Q86WZ6 799 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 SIAH3Q8IW03 269 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 ANKRD53Q8N9V6 530 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 ELP5Q8TE02 316 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 GRK7Q8WTQ7 553 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 NEIL2Q969S2 332 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 FBXL8Q96CD0 374 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 SNF8Q96H20 258 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 ZNF354BQ96LW1 612 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 PWWP2AQ96N64 755 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 FRMD6Q96NE9 622 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 KCNK13Q9HB14 408 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 TEKT2Q9UIF3 430 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 ZNF835Q9Y2P0 537 aa15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 TRBC2A0A5B9 178 aa15.35■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 CES2O00748 559 aa15.35■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 TP73O15350 636 aa15.35■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 TTC4O95801 387 aa15.35■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 FHP07954 510 aa15.35■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 AP1S2P56377 157 aa15.35■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 HERC3Q15034 1050 aa15.35■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 CDSNQ15517 529 aa15.35■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 OR1C1Q15619 314 aa15.35■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 MEP1AQ16819 746 aa15.35■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 HECTD2Q5U5R9 776 aa15.35■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 KIF2BQ8N4N8 673 aa15.35■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 SUN3Q8TAQ9 357 aa15.35■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 NT5CQ8TCD5 201 aa15.35■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 HAUS8Q9BT25 410 aa15.35■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 ARL15Q9NXU5 204 aa15.35■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 SNX12Q9UMY4 172 aa15.35■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa15.34■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 GABRR3A8MPY1 467 aa15.34■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 CCL21O00585 134 aa15.34■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 OR1F1O43749 312 aa15.34■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 SLC19A2O60779 497 aa15.34■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 SMIM10L1P0DMW3 83 aa15.34■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 ALOX12P18054 663 aa15.34■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 IL10P22301 178 aa15.34■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 SCTRP47872 440 aa15.34■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 CCR8P51685 355 aa15.34■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 REEP5Q00765 189 aa15.34■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 PWP1Q13610 501 aa15.34■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 PPP1R7Q15435 360 aa15.34■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 NSDHLQ15738 373 aa15.34■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 C3AR1Q16581 482 aa15.34■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 DEFB134Q4QY38 66 aa15.34■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 STEAP4Q687X5 459 aa15.34■□□□□ 0.05
RPL28-205ENST00000558131 SPINK14Q6IE38 97 aa15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms