RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555964.5

XRCC3-215, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, humanhuman

TSL 4

Gene XRCC3, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC3-215ENST00000555964 VPS41P49754 854 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 OR4D2P58180 307 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 SLC26A5P58743 744 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 RHAGQ02094 409 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 CTBP1Q13363 440 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 LCTLQ6UWM7 567 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 CYHR1Q6ZMK1 362 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 CEP97Q8IW35 865 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 DENND6AQ8IWF6 608 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 MFSD9Q8NBP5 474 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 MCUQ8NE86 351 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 TMEM125Q96AQ2 219 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 TBC1D20Q96BZ9 403 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 PEX11GQ96HA9 241 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 OLFM1Q99784 485 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 HIST1H2AJQ99878 128 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 VKORC1Q9BQB6 163 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 H2AFJQ9BTM1 129 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 PARVBQ9HBI1 364 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 COQ3Q9NZJ6 369 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 MED16Q9Y2X0 877 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 FEZF1A0PJY2 475 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 FANCGO15287 622 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 FHP07954 510 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 CYB561P49447 251 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 RGS1Q08116 209 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 PWP1Q13610 501 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 MAPKAPK3Q16644 382 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 ZNF549Q6P9A3 640 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 AGTRAPQ6RW13 159 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 SLC26A11Q86WA9 606 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 SIAH3Q8IW03 269 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 MYO1HQ8N1T3 1032 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 KCT2Q8NC54 265 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 HES7Q9BYE0 225 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 RBSNQ9H1K0 784 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 FBXO5Q9UKT4 447 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 PDZD2O15018 2839 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 CSMD2Q7Z408 3487 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 FCHO1O14526 889 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 NDUFS4O43181 175 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 CEP104O60308 925 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 NME2P1O60361 137 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 NEURL1O76050 574 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 CDH1P12830 882 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 NME2P22392 152 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 COILP38432 576 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 CCR8P51685 355 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 TERF1P54274 439 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 NAE1Q13564 534 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 ABHD13Q7L211 337 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 PDSS2Q86YH6 399 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 GPATCH11Q8N954 259 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 SPC24Q8NBT2 197 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 ARMC2Q8NEN0 867 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 ELP5Q8TE02 316 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 AGAP11Q8TF27 550 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 NPAS2Q99743 824 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 MACROD1Q9BQ69 325 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 TRIM51Q9BSJ1 452 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 SARGQ9BW04 601 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 SGPP1Q9BX95 441 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 RBCK1Q9BYM8 510 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 CDCP1Q9H5V8 836 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 LANCL2Q9NS86 450 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 TAS2R13Q9NYV9 303 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 PDE10AQ9Y233 779 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa15.91■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 URADA6NGE7 173 aa15.91■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 KRT14P02533 472 aa15.91■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 ALOX12P18054 663 aa15.91■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 QSOX2Q6ZRP7 698 aa15.91■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 STRA8Q7Z7C7 330 aa15.91■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa15.91■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 ABHD11Q8NFV4 315 aa15.91■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 TRIM58Q8NG06 486 aa15.91■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 TSLPQ969D9 159 aa15.91■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 SERPINB12Q96P63 405 aa15.91■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 TRIM54Q9BYV2 358 aa15.91■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 ATG10Q9H0Y0 220 aa15.91■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 MCCC2Q9HCC0 563 aa15.91■□□□□ 0.14
XRCC3-215ENST00000555964 PPT2Q9UMR5 302 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms