RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555296.1

MED6-208, Transcript of mediator complex subunit 6, human

TSL 2

Gene MED6, Length 856 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED6-208	ENST00000555296	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296		A8MVM7	634 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	KIF5C	O60282	957 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	SLC16A8	O95907	504 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	GH1	P01241	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	IGHE	P01854	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	MMP12	P39900	470 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	ST8SIA6	P61647	398 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	DRP2	Q13474	957 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	MTF1	Q14872	753 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	FUT8	Q9BYC5	575 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	SLC1A7	O00341	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	PGRMC2	O15173	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	SCO2	O43819	266 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	RAD51D	O75771	328 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	CEACAM4	O75871	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	GOT1	P17174	413 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	ASIC1	P78348	528 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	ABR	Q12979	859 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	PPA1	Q15181	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	SIAH3	Q8IW03	269 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	POLK	Q9UBT6	870 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	POMT2	Q9UKY4	750 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	PFAS	O15067	1338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6-208	ENST00000555296	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296		A0A087WZ39	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	ACSL4	O60488	711 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	MT-ND2	P03891	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	MACC1	Q6ZN28	852 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	CASP10	Q92851	521 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	OMA1	Q96E52	524 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	IL12RB2	Q99665	862 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	GPR173	Q9NS66	373 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	PRKACG	P22612	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	HUNK	P57058	714 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	IRX4	P78413	519 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	ARHGAP1	Q07960	439 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	TDH	Q8IZJ6	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	ZNF519	Q8TB69	540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED6-208	ENST00000555296	SAP25	Q8TEE9	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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