RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-233ENST00000552688 PLAG1Q6DJT9 500 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 OTOAQ7RTW8 1153 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 LRRC6Q86X45 466 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 IFT20Q8IY31 132 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 CPNE9Q8IYJ1 553 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 AMER3Q8N944 861 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 C10orf90Q96M02 699 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 BIRC8Q96P09 236 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 GPR21Q99679 349 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 OLFM1Q99784 485 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 MIPEPQ99797 713 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 DPH7Q9BTV6 452 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 DRC3Q9H069 523 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 CCDC68Q9H2F9 335 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 CAB39LQ9H9S4 337 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 ABCF3Q9NUQ8 709 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 COQ3Q9NZJ6 369 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 ZFATQ9P243 1243 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 TINAGQ9UJW2 476 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 NFS1Q9Y697 457 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 F8P00451 2351 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 FAM221AA4D161 298 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 SMIM23A6NLE4 172 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 C19orf84I3L1E1 186 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 PRRG2O14669 202 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.372e-6■■■■□ 21.8
CS-233ENST00000552688 FOXS1O43638 330 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 ASNA1O43681 348 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 TSPAN12O95859 305 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 AHSGP02765 367 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 EZRP15311 586 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 ABOP16442 354 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.371e-6■■■■□ 26.3
CS-233ENST00000552688 ATP5DP30049 168 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 AGTR2P50052 363 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 CSNK1G2P78368 415 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 ABATP80404 500 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 TUBA3CQ13748 450 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 SLMAPQ14BN4 828 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 EXT1Q16394 746 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 BTBD16Q32M84 506 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 LGI4Q8N135 537 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 GHDCQ8N2G8 530 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 SPATA6LQ8N4H0 392 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 MDS2Q8NDY4 140 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 M1APQ8TC57 530 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 CALML6Q8TD86 181 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 SMPDL3AQ92484 453 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 LRRC39Q96DD0 335 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 SCMH1Q96GD3 660 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 OR2A5Q96R48 311 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 CYTH2Q99418 400 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 NAT9Q9BTE0 207 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 MMP25Q9NPA2 562 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 MED16Q9Y2X0 877 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 ANKRD12Q6UB98 2062 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-233ENST00000552688 A0A1W2PPV9 198 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-233ENST00000552688 FAM159BA6NKW6 160 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-233ENST00000552688 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-233ENST00000552688 FAM227AF5H4B4 570 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-233ENST00000552688 H3BMM5 538 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-233ENST00000552688 PFDN6O15212 129 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-233ENST00000552688 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-233ENST00000552688 MATN4O95460 622 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-233ENST00000552688 SYF2O95926 243 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-233ENST00000552688 C1QAP02745 245 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-233ENST00000552688 ESR1P03372 595 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-233ENST00000552688 CELA2AP08217 269 aa6.46□□□□□ -1.38
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