RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 HYAL2Q12891 473 aa22.05■■□□□ 1.12
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CTDSP2-203ENST00000547701 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 LGSNQ5TDP6 509 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 KLC3Q6P597 504 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM151BQ8IW70 566 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 KRT78Q8N1N4 520 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 LRRN4CLQ8ND94 238 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 OR9A4Q8NGU2 314 aa22.05■■□□□ 1.12
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CTDSP2-203ENST00000547701 EFCAB11Q9BUY7 163 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC25A23Q9BV35 468 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa22.05■■□□□ 1.12
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CTDSP2-203ENST00000547701 GCAP28676 217 aa22.04■■□□□ 1.12
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CTDSP2-203ENST00000547701 LAPTM5Q13571 262 aa22.04■■□□□ 1.12
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CTDSP2-203ENST00000547701 ADPRMQ3LIE5 342 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM205Q6UW68 189 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF605Q86T29 641 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 LAPTM4BQ86VI4 370 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 LCA5Q86VQ0 697 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 CLEC1AQ8NC01 280 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 OR11G2Q8NGC1 345 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 MOCOSQ96EN8 888 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 OR1F2PQ96R84 312 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 RHBGQ9H310 441 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 C3orf18Q9UK00 162 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 TMCO1Q9UM00 188 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa22.04■■□□□ 1.12
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CTDSP2-203ENST00000547701 K7EPI3 171 aa22.03■■□□□ 1.12
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CTDSP2-203ENST00000547701 MYBPC3Q14896 1274 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 SETDB1Q15047 1291 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 FAM153CQ494X1 144 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 TECRLQ5HYJ1 363 aa22.03■■□□□ 1.12
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CTDSP2-203ENST00000547701 ABHD13Q7L211 337 aa22.03■■□□□ 1.12
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CTDSP2-203ENST00000547701 GALNT16Q8N428 558 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 OR51Q1Q8NH59 317 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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CTDSP2-203ENST00000547701 KLHL18O94889 574 aa22.02■■□□□ 1.12
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CTDSP2-203ENST00000547701 ASB18Q6ZVZ8 466 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 PRSS41Q7RTY9 318 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 FDCSPQ8NFU4 85 aa22.02■■□□□ 1.12
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CTDSP2-203ENST00000547701 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 SCN2AQ99250 2005 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDSP2-203ENST00000547701 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-203ENST00000547701 K7EM74 188 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-203ENST00000547701 UGDHO60701 494 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-203ENST00000547701 HPP00738 406 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-203ENST00000547701 IL1RNP18510 177 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-203ENST00000547701 PGDP52209 483 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-203ENST00000547701 CHAF1BQ13112 559 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-203ENST00000547701 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-203ENST00000547701 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC29A2Q14542 456 aa22.01■■□□□ 1.11
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