RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 GRID1Q9ULK0 1009 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 COQ4Q9Y3A0 265 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 SCN4AP35499 1836 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 STRCP1A6NGW2 1772 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 A0A1B0GVG6 124 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 CTDSP2O14595 271 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 CAPN9O14815 690 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 WDR46O15213 610 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 KCNN4O15554 427 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 DENRO43583 198 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 MED24O75448 989 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 TM7SF2O76062 418 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 KCNK5O95279 499 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 LINC00271P0C7V0 271 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 SMIM18P0DKX4 95 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 S1PR1P21453 382 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 SLCO1A2P46721 670 aa4.83□□□□□ -1.64
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TRDN-204ENST00000542443 CASP4P49662 377 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 PDLIM4P50479 330 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 DSCR9P59020 149 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 GABPAQ06546 454 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 DLG1Q12959 904 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 TMED1Q13445 227 aa4.83□□□□□ -1.64
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TRDN-204ENST00000542443 RCN1Q15293 331 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 CAVIN4Q5BKX8 364 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 KCNT1Q5JUK3 1230 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 C18orf63Q68DL7 685 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 KLC3Q6P597 504 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 MCEMP1Q8IX19 187 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 SCYL3Q8IZE3 742 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 MARVELD2Q8N4S9 558 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 CCDC89Q8N998 374 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 IL17RCQ8NAC3 791 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 PPFIBP2Q8ND30 876 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 HMGCLL1Q8TB92 370 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 NAT14Q8WUY8 206 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 SHC3Q92529 594 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 FAM20AQ96MK3 541 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 GBP5Q96PP8 586 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 ECSITQ9BQ95 431 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 TEX12Q9BXU0 123 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 OSBPL8Q9BZF1 889 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 PDE7BQ9NP56 450 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 TAS2R14Q9NYV8 317 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 ZNF224Q9NZL3 707 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 SIX4Q9UIU6 781 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 RPS6KA6Q9UK32 745 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 FBXL2Q9UKC9 423 aa4.83□□□□□ -1.64
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TRDN-204ENST00000542443 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 E9PMD0 336 aa4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 HS3ST1O14792 307 aa4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 PSTPIP1O43586 416 aa4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 TMCC2O75069 709 aa4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 KRT36O76013 467 aa4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 PMS2P2O95744 297 aa4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 CD48P09326 243 aa4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 NR2F1P10589 423 aa4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 KRT13P13646 458 aa4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 UQCRBP14927 111 aa4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 ANPEPP15144 967 aa4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 COPB2P35606 906 aa4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 MAGEA4P43358 317 aa4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 GYG1P46976 350 aa4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 NRIP1P48552 1158 aa4.82□□□□□ -1.64
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TRDN-204ENST00000542443 NTRK2Q16620 822 aa4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 DNAL1Q4LDG9 190 aa4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 C1orf220Q5T0J3 134 aa4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 RFWD3Q6PCD5 774 aa4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 C1orf186Q6ZWK4 172 aa4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 SFR1Q86XK3 245 aa4.82□□□□□ -1.64
TRDN-204ENST00000542443 DNAAF5Q86Y56 855 aa4.82□□□□□ -1.64
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