RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534076.1

CASC23-201, Transcript of cancer susceptibility 23, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC23, Length 1,563 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC23-201ENST00000534076 ZNF33BQ06732 778 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 TGM3Q08188 693 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 IFT88Q13099 833 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 TRAF3Q13114 568 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 GPS2Q13227 327 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 HERC3Q15034 1050 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 HKDC1Q2TB90 917 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 UNC50Q53HI1 259 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 FRMD7Q6ZUT3 714 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 C10orf107Q8IVU9 208 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 CCNYL1Q8N7R7 359 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 GALNT6Q8NCL4 622 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 OR7G3Q8NG95 312 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 OR4F6Q8NGB9 312 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 OR52B6Q8NGF0 335 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 TRPC4APQ8TEL6 797 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 NKD1Q969G9 470 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 GBP5Q96PP8 586 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 CENPKQ9BS16 269 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 GSTO2Q9H4Y5 243 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 STARD5Q9NSY2 213 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 PSD3Q9NYI0 1048 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 KCND3Q9UK17 655 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 PPT2Q9UMR5 302 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 SNX6Q9UNH7 406 aa7.25□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 TMEM120BA0PK00 339 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 C9J4A7 227 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 P2RX6O15547 441 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 NPHS1O60500 1241 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 NSA2O95478 260 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 ESRRBO95718 433 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 ONECUT2O95948 504 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 ALBP02768 609 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 ENO1P06733 434 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 CTSBP07858 339 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 RAB40ALP0C0E4 278 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 PCNAP12004 261 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 ALOX12P18054 663 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 ALDH3A1P30838 453 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 TSFMP43897 325 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 SERPINB4P48594 390 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 UCNP55089 124 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 CDH13P55290 713 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 RPS15P62841 145 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 CLN3Q13286 438 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 ADPRMQ3LIE5 342 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 TMEM35AQ53FP2 167 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 BROXQ5VW32 411 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 FRG2Q64ET8 278 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 TRIM40Q6P9F5 258 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 CHSY3Q70JA7 882 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 NUDCD3Q8IVD9 361 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 KIRREL3Q8IZU9 778 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 SLC38A9Q8NBW4 561 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 WDR20Q8TBZ3 569 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 CREB3L4Q8TEY5 395 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 AGAP11Q8TF27 550 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 CCT6BQ92526 530 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 MR1Q95460 341 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 FKBP10Q96AY3 582 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 CMTM7Q96FZ5 175 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 C10orf90Q96M02 699 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 CDK15Q96Q40 435 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 FRG2BQ96QU4 278 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 GPR87Q9BY21 358 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 SLC29A3Q9BZD2 475 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 ELOVL6Q9H5J4 265 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 SYNPO2LQ9H987 977 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 ANKHQ9HCJ1 492 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 ZNF304Q9HCX3 659 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.24□□□□□ -1.25
CASC23-201ENST00000534076 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms