RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	TMED2	Q15363	201 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	NDUFA9	Q16795	377 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	FAM166B	A8MTA8	275 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	TXNDC9	O14530	226 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	RAF1	P04049	648 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CELA3A	P09093	270 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CTNNA2	P26232	953 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	OLR1	P78380	273 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	NAA25	Q14CX7	972 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ADCK2	Q7Z695	626 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ALG3	Q92685	438 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	IQCD	Q96DY2	449 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	SLC30A3	Q99726	388 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557		A8MUA0	341 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557		G3V3Y1	287 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	SMAP	O00193	183 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	SYT5	O00445	386 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ADRA1D	P25100	572 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ARNT	P27540	789 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	PTPN7	P35236	360 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	COPS2	P61201	443 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	MPP1	Q00013	466 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CYP4X1	Q8N118	509 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC42	Q96M95	316 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	TTC1	Q99614	292 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	INTU	Q9ULD6	942 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	HIVEP2	P31629	2446 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557		F8W8V4	182 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CDK2AP1	O14519	115 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CHST10	O43529	356 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	B4GALT2	O60909	372 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	FH	P07954	510 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CD53	P19397	219 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	FMO4	P31512	558 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	PRAME	P78395	509 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CRADD	P78560	199 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ABAT	P80404	500 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CDH17	Q12864	832 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	HYAL2	Q12891	473 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	XKR6	Q5GH73	641 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		11.3	□□□□□ -0.6

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