RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533012.1

TRAPPC4-211, Transcript of trafficking protein particle complex 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC4, Length 817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4-211ENST00000533012 DSCR3O14972 297 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 P2RX6O15547 441 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 NPHS1O60500 1241 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 CRCPO75575 148 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 OR4F21O95013 312 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 ESRRBO95718 433 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 DLGAP3O95886 979 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 C1QTNF9P0C862 333 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 LIPCP11150 499 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 SERPINB5P36952 375 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 PIK3CBP42338 1070 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 GCGRP47871 477 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 ATP1A2P50993 1020 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 DCDP81605 110 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 DMTNQ08495 405 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 IFT88Q13099 833 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 FAM53BQ14153 422 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 GGTA1PQ4G0N0 100 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 C1orf189Q5VU69 101 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 LETMD1Q6P1Q0 360 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 PRMT9Q6P2P2 845 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 CHSY3Q70JA7 882 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 ABHD13Q7L211 337 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 SYVN1Q86TM6 617 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 DSELQ8IZU8 1212 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 KCT2Q8NC54 265 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 METTL6Q8TCB7 284 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 MR1Q95460 341 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 NKD1Q969G9 470 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 CMTM7Q96FZ5 175 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 ELOVL6Q9H5J4 265 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 MLXIPLQ9NP71 852 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 LHX9Q9NQ69 397 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 WDR70Q9NW82 654 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 TRPS1Q9UHF7 1281 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 SNX6Q9UNH7 406 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC22A7Q9Y694 548 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 A0A1B0GTL3 188 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 A0A1B0GX78 115 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 TMEM8BA6NDV4 472 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 FFAR3O14843 346 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 GPR42O15529 346 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 RRP8O43159 456 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 ULK1O75385 1050 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 TGFB1P01137 390 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 KRT6AP02538 564 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 KRT6BP04259 564 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 CAPNS1P04632 268 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 SERPINE1P05121 402 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 ENO1P06733 434 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 CAPN1P07384 714 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 GRK2P25098 689 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 HMOX2P30519 316 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 RORAP35398 523 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 AVPR1BP47901 424 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 KRT6CP48668 564 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 NEK2P51955 445 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 WDR4P57081 412 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 PPP2R2AP63151 447 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 SKP1P63208 163 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 TGM3Q08188 693 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 STX3Q13277 289 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 HERC3Q15034 1050 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 CHI3L2Q15782 390 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 SGO1Q5FBB7 561 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 FRG2Q64ET8 278 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 NIPAL1Q6NVV3 410 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 DTX1Q86Y01 620 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 TRIM42Q8IWZ5 723 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 HOMEZQ8IX15 550 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 IL22RA1Q8N6P7 574 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 CDYL2Q8N8U2 506 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 OR6Y1Q8NGX8 325 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 HUS1BQ8NHY5 278 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 WDR20Q8TBZ3 569 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 AGAP11Q8TF27 550 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 COL26A1Q96A83 441 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 MVB12AQ96EY5 273 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms