RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531490.1

TRIM53CP-201, Transcript of tripartite motif containing 53C, pseudogene, humanhuman

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Gene TRIM53CP, Length 1,354 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM53CP-201ENST00000531490 BDKRB1P46663 353 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 HSD11B2P80365 405 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 KYNUQ16719 465 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 KLHL38Q2WGJ6 581 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 ARMC3Q5W041 872 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 KLHL35Q6PF15 583 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 KCNMB4Q86W47 210 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 PDIK1LQ8N165 341 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 D2HGDHQ8N465 521 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 UBXN4Q92575 508 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 CFAP36Q96G28 342 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 SNF8Q96H20 258 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 C5orf34Q96MH7 638 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 RUNDC3BQ96NL0 473 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 PANX3Q96QZ0 392 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 NDNQ99608 321 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 GPR21Q99679 349 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 LRRC1Q9BTT6 524 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 PITPNM3Q9BZ71 974 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 ACSS2Q9NR19 701 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 FGF21Q9NSA1 209 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 POLG2Q9UHN1 485 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 CDC23Q9UJX2 597 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 POMT2Q9UKY4 750 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 PSAT1Q9Y617 370 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 C2orf74A8MZ97 194 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 ISM1B1AKI9 464 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 E7ESA3 106 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 CD9P21926 228 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 PTPN4P29074 926 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 SSTR1P30872 391 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 GRIA3P42263 894 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 PLTPP55058 493 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 CDKN2DP55273 166 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 ARL4CP56559 192 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 PRKAA1Q13131 559 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 TUBB3Q13509 450 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 IL11RAQ14626 422 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 UGT8Q16880 541 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 STEAP4Q687X5 459 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 LCN10Q6JVE6 187 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 SPESP1Q6UW49 350 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 ZBTB2Q8N680 514 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 FBXO36Q8NEA4 188 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 OR1L3Q8NH93 324 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 CD200R1Q8TD46 325 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 DLG3Q92796 817 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 CERS2Q96G23 380 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 CD180Q99467 661 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 TSSK1BQ9BXA7 367 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 OR6C2Q9NZP2 312 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 DHRS7Q9Y394 339 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM53CP-201ENST00000531490 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.69□□□□□ -1.34
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