RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516104.1

RNU6-513P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 513, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-513P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-513P-201ENST00000516104 A0A0U1RQS6 177 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 A0A1W2PPC1 479 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 FAM234BA2RU67 622 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 ZNF879B4DU55 563 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 H7C1Q1 480 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 IMPA2O14732 288 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 TCAPO15273 167 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 INPP4BO15327 924 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 LYRM1O43325 122 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 ULK1O75385 1050 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 CBR3O75828 277 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 ENDOD1O94919 500 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 PDE8BO95263 885 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 SLC34A2O95436 690 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 NSA2O95478 260 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 RAB3DO95716 219 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 IL1AP01583 271 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 MBP02144 154 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 OPN1MWP04001 364 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 CRHP06850 196 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 USP17L7P0C7H9 530 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 OPN1MW2P0DN77 364 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 OPN1MW3P0DN78 364 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 ODC1P11926 461 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 CD58P19256 250 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 NFKB1P19838 968 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 C5AR1P21730 350 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 GPX3P22352 226 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 ITPKAP23677 461 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 DNASE1P24855 282 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 MPSTP25325 297 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 ACADLP28330 430 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 ALDH4A1P30038 563 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 CCR7P32248 378 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 MAGEA2P43356 314 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 KCNQ1P51787 676 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 NUDT6P53370 316 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 ARPP19P56211 112 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 PPP3R1P63098 170 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 ERVK-25P63136 954 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 IL5RAQ01344 420 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 EMX2Q04743 252 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 CCINQ13939 588 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 OPCMLQ14982 345 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 PGM5Q15124 567 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 NR6A1Q15406 480 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 ECM1Q16610 540 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 VPS26BQ4G0F5 336 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 SPANXN3Q5MJ09 141 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 HECTD3Q5T447 861 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 ADGRF1Q5T601 910 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 RNLSQ5VYX0 342 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 VASNQ6EMK4 673 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 ZNF790Q6PG37 636 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 PAMR1Q6UXH9 720 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 C17orf107Q6ZR85 190 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 ZNF720Q7Z2F6 126 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 SERINC5Q86VE9 423 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 SLC47A2Q86VL8 602 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 FAM178BQ8IXR5 827 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 ZNF561Q8N587 486 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 TRAM1L1Q8N609 369 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 BEND2Q8NDZ0 799 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 IPMKQ8NFU5 416 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 HMGCLL1Q8TB92 370 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 IP6K1Q92551 441 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 NR4A3Q92570 626 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 COQ8BQ96D53 544 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 MYO19Q96H55 970 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 C14orf144Q96I85 54 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 ZNF354BQ96LW1 612 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 KREMEN1Q96MU8 473 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 NT5C1BQ96P26 610 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 RBBP8Q99708 897 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 ZNF559Q9BR84 538 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 REEP2Q9BRK0 252 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 TMED9Q9BVK6 235 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 ERVK-6Q9BXR3 956 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 BEX2Q9BXY8 128 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 ACTR6Q9GZN1 396 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 EVA1AQ9H8M9 152 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 CERS4Q9HA82 394 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 CDHR5Q9HBB8 845 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 PLAC1Q9HBJ0 212 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-513P-201ENST00000516104 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms