RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 NFE4Q86UQ8 179 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 OR7A2PQ8NGA2 310 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 HAS2Q92819 552 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 SAMD8Q96LT4 415 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNK16Q96T55 309 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 PIGVQ9NUD9 493 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 MAN1B1Q9UKM7 699 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP6V1G1O75348 118 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 GRAP2O75791 330 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 DFFBO76075 338 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM16O95361 564 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 DNA2P51530 1060 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 HSD17B7P56937 341 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 HERV-K104P61576 105 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 CDH18Q13634 790 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 EXT1Q16394 746 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 XKR6Q5GH73 641 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 G2E3Q7L622 706 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 ADCK1Q86TW2 530 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 HSCBQ8IWL3 235 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 CNPY4Q8N129 248 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 POC1AQ8NBT0 407 aa6.95□□□□□ -1.3
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PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM143Q96AN5 459 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 NTMT1Q9BV86 223 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 DPEP2Q9H4A9 486 aa6.95□□□□□ -1.3
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PGGT1B-205ENST00000514178 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 TAAR2Q9P1P5 351 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC162PA2VCL2 907 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 MTMR11A4FU01 709 aa6.94□□□□□ -1.3
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PGGT1B-205ENST00000514178 KIF5CO60282 957 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 SOCS5O75159 536 aa6.94□□□□□ -1.3
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PGGT1B-205ENST00000514178 MYL7Q01449 175 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 KEAP1Q14145 624 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 EPC2Q52LR7 807 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 PIGZQ86VD9 579 aa6.94□□□□□ -1.3
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PGGT1B-205ENST00000514178 MAB21L3Q8N8X9 362 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 SEPT8Q92599 483 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 CD101Q93033 1021 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 ALG14Q96F25 216 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 PIGQQ9BRB3 760 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC2Q9BYS8 371 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 NYXQ9GZU5 481 aa6.94□□□□□ -1.3
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PGGT1B-205ENST00000514178 CHUKO15111 745 aa6.93□□□□□ -1.3
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PGGT1B-205ENST00000514178 CDK4P11802 303 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF18P17022 549 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 MARK3P27448 753 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 KIF5BP33176 963 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 DCTP40126 519 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 CLCN4P51793 760 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 KARSQ15046 597 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 P2RY6Q15077 328 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 INAQ16352 499 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-205ENST00000514178 WDR38Q5JTN6 314 aa6.93□□□□□ -1.3
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