RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511439.5

TOPBP1-208, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, human

TSL 5

Gene TOPBP1, Length 1,142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	HDAC11	Q96DB2	347 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	B3GALT6	Q96L58	329 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	TTC14	Q96N46	770 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	IL17F	Q96PD4	163 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	GFI1	Q99684	422 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	CSTL1	Q9H114	145 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	KLHL1	Q9NR64	748 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	LAD1	O00515	517 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	CLGN	O14967	610 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	ADAMDEC1	O15204	470 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	GRID2	O43424	1007 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	FIBP	O43427	364 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	PRKAB2	O43741	272 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF217	O75362	1048 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	STAM2	O75886	525 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	TSPY3	P0CV98	308 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	TSPY8	P0CW00	308 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	MMP9	P14780	707 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	HRH2	P25021	359 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	PTGER4	P35408	488 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	CCR2	P41597	374 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	MLLT10	P55197	1068 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	ERVFC1-1	P60608	527 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	ISL1	P61371	349 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	KLRB1	Q12918	225 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	DNAJC3	Q13217	504 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	BECN1	Q14457	450 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	DLG2	Q15700	870 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	PSMD5	Q16401	504 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	RAB6C	Q53S08	254 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	KRT79	Q5XKE5	535 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	CTR9	Q6PD62	1173 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	AACS	Q86V21	672 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	KMT5C	Q86Y97	462 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	CEP97	Q8IW35	865 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	NAGS	Q8N159	534 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	BBS10	Q8TAM1	723 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	CENPT	Q96BT3	561 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	SMC6	Q96SB8	1091 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	AZI2	Q9H6S1	392 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	STX8	Q9UNK0	236 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	3.36	□□□□□ -1.87	3e-6	■■■■■ 44.6
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	COL1A2	P08123	1366 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	KNTC1	P50748	2209 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	PRAC2	D3DTV9	90 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	PRRG1	O14668	218 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	CDH1	P12830	882 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	PRLR	P16471	622 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	NNMT	P40261	264 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	FUT6	P51993	359 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	COG7	P83436	770 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	RUNX1T1	Q06455	604 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	RUNX3	Q13761	415 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	GTF2H2	Q13888	395 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	TEAD2	Q15562	447 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOPBP1-208	ENST00000511439	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87

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