RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	SHB	Q15464	509 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	CYP1B1	Q16678	543 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIM16L	Q309B1	348 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	PLA1A	Q53H76	456 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	RAB41	Q5JT25	222 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	LIPN	Q5VXI9	398 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	NUDT13	Q86X67	352 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	CDK20	Q8IZL9	346 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	FUK	Q8N0W3	1084 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC185	Q8N715	623 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF366	Q8N895	744 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	TERB1	Q8NA31	727 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	POC5	Q8NA72	575 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	NFKBID	Q8NI38	313 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF596	Q8TC21	504 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	ELMO1	Q92556	727 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	MTERF3	Q96E29	417 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	APOPT1	Q96IL0	206 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	MS4A14	Q96JA4	679 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	PRRC1	Q96M27	445 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	CASD1	Q96PB1	797 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	ABHD1	Q96SE0	405 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	PKMYT1	Q99640	499 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	SYT15	Q9BQS2	421 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF32	Q9H0A6	362 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	MARCH7	Q9H992	704 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	TTC3	P53804	2025 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	HELT	A6NFD8	242 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	GABRR3	A8MPY1	467 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF487	B1APH4	448 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971		E5RJQ4	531 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971		H7C4K7	107 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	CYR61	O00622	381 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	GRID2	O43424	1007 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	CST8	O60676	142 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	MAGEC1	O60732	1142 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	ATG13	O75143	517 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	CDH16	O75309	829 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	FBXO24	O75426	580 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	GPX5	O75715	221 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	CCNK	O75909	580 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	DFFB	O76075	338 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	EFEMP2	O95967	443 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	TGFB1	P01137	390 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	IL1B	P01584	269 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	FGG	P02679	453 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	COX5B	P10606	129 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	SPINK2	P20155	84 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	ITGAL	P20701	1170 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	HNF1A	P20823	631 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	GPD1	P21695	349 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	C5AR1	P21730	350 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	BSG	P35613	385 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	GRK3	P35626	688 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	PGM1	P36871	562 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	NPY2R	P49146	381 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	PGD	P52209	483 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	OGDH	Q02218	1023 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	OLIG2	Q13516	323 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	FGL2	Q14314	439 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	TAZ	Q16635	292 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC36A3	Q495N2	470 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIM60	Q495X7	471 aa		6.52	□□□□□ -1.37

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