RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 ASB1Q9Y576 335 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 DOCK10Q96BY6 2186 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 A0A087X1B8 175 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 A0A096LPK6 155 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 SUPT3HB4E1H0 165 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 H0YIG0 161 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 MAP2K7O14733 419 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 PRAMEF4O60810 478 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 KERAO60938 352 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 DNAJB6O75190 326 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 SUPT3HO75486 399 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 STK16O75716 305 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 BMP10O95393 424 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 S100BP04271 92 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 INHBAP08476 426 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 ACPPP15309 386 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 ITGA3P26006 1051 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 TYK2P29597 1187 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 AHRP35869 848 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 CASRP41180 1078 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 AGTR2P50052 363 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 SERPINB8P50452 374 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 CSRP3P50461 194 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 OLR1P78380 273 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 TLE1Q04724 770 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 RGS1Q08116 209 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 PWP1Q13610 501 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 MYBPC3Q14896 1274 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 TUBB8Q3ZCM7 444 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 NADK2Q4G0N4 442 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 DEFB134Q4QY38 66 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 CDKL4Q5MAI5 379 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 MFSD4BQ5TF39 518 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 ATG9BQ674R7 924 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 AMER2Q8N7J2 671 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 OR5T3Q8NGG3 340 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 STAG3L4Q8TBR4 150 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 NT5CQ8TCD5 201 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 NACC2Q96BF6 587 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 ATOH8Q96SQ7 321 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 PAFAH2Q99487 392 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 RBCK1Q9BYM8 510 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 TGIF2Q9GZN2 237 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 VPS11Q9H270 941 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 KLHL31Q9H511 634 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 ZNF160Q9HCG1 818 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 C14orf105Q9NVL8 296 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 NUDT4Q9NZJ9 180 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 MKL2Q9ULH7 1088 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 SLC22A7Q9Y694 548 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 NUP210LQ5VU65 1888 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 COL12A1Q99715 3063 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 IPO13O94829 963 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 FAM153BP0C7A2 387 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 ALOX12P18054 663 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 MSH2P43246 934 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 XCR1P46094 333 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 CD97P48960 835 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 MLLT10P55197 1068 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 RAB8AP61006 207 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 Q0VFX4 171 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 HYAL2Q12891 473 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 HERC3Q15034 1050 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 PDK4Q16654 411 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 FAM83EQ2M2I3 478 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 FAM153CQ494X1 144 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 MINDY4Q4G0A6 757 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 CREB3L4Q8TEY5 395 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 PEX11GQ96HA9 241 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 CD244Q9BZW8 370 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 SLC6A16Q9GZN6 736 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 VN1R1Q9GZP7 353 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 AICDAQ9GZX7 198 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
NISCH-214ENST00000490425 ZNF358Q9NW07 568 aa11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms